Protein–RNA interactions for Protein: Q96D59

RNF183, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF183, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF183Q96D59 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RNF183Q96D59 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RNF183Q96D59 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RNF183Q96D59 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RNF183Q96D59 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RNF183Q96D59 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RNF183Q96D59 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RNF183Q96D59 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RNF183Q96D59 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RNF183Q96D59 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RNF183Q96D59 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RNF183Q96D59 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RNF183Q96D59 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RNF183Q96D59 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RNF183Q96D59 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
RNF183Q96D59 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
RNF183Q96D59 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
RNF183Q96D59 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
RNF183Q96D59 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
RNF183Q96D59 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
RNF183Q96D59 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
RNF183Q96D59 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
RNF183Q96D59 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
RNF183Q96D59 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
RNF183Q96D59 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
RNF183Q96D59 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
RNF183Q96D59 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.32
RNF183Q96D59 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
RNF183Q96D59 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
RNF183Q96D59 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
RNF183Q96D59 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RNF183Q96D59 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
RNF183Q96D59 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RNF183Q96D59 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RNF183Q96D59 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RNF183Q96D59 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
RNF183Q96D59 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
RNF183Q96D59 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RNF183Q96D59 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RNF183Q96D59 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
RNF183Q96D59 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RNF183Q96D59 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RNF183Q96D59 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RNF183Q96D59 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
RNF183Q96D59 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RNF183Q96D59 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RNF183Q96D59 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RNF183Q96D59 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RNF183Q96D59 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
RNF183Q96D59 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RNF183Q96D59 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RNF183Q96D59 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RNF183Q96D59 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RNF183Q96D59 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RNF183Q96D59 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RNF183Q96D59 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RNF183Q96D59 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
RNF183Q96D59 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
RNF183Q96D59 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RNF183Q96D59 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RNF183Q96D59 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RNF183Q96D59 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RNF183Q96D59 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RNF183Q96D59 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
RNF183Q96D59 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
RNF183Q96D59 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
RNF183Q96D59 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RNF183Q96D59 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RNF183Q96D59 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
RNF183Q96D59 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RNF183Q96D59 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
RNF183Q96D59 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
RNF183Q96D59 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
RNF183Q96D59 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC13.01□□□□□ -0.33
RNF183Q96D59 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
RNF183Q96D59 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RNF183Q96D59 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
RNF183Q96D59 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC13.01□□□□□ -0.33
RNF183Q96D59 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
RNF183Q96D59 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC13.01□□□□□ -0.33
RNF183Q96D59 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
RNF183Q96D59 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
RNF183Q96D59 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
RNF183Q96D59 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
RNF183Q96D59 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
RNF183Q96D59 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
RNF183Q96D59 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
RNF183Q96D59 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
RNF183Q96D59 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RNF183Q96D59 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
RNF183Q96D59 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
RNF183Q96D59 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
RNF183Q96D59 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RNF183Q96D59 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RNF183Q96D59 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
RNF183Q96D59 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
RNF183Q96D59 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
RNF183Q96D59 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
RNF183Q96D59 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RNF183Q96D59 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms