Protein–RNA interactions for Protein: Q93088

BHMT, Betaine--homocysteine S-methyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHMTQ93088 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BHMTQ93088 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BHMTQ93088 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BHMTQ93088 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BHMTQ93088 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BHMTQ93088 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
BHMTQ93088 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BHMTQ93088 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BHMTQ93088 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BHMTQ93088 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BHMTQ93088 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BHMTQ93088 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BHMTQ93088 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
BHMTQ93088 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BHMTQ93088 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BHMTQ93088 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BHMTQ93088 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BHMTQ93088 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
BHMTQ93088 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BHMTQ93088 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BHMTQ93088 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
BHMTQ93088 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BHMTQ93088 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BHMTQ93088 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
BHMTQ93088 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BHMTQ93088 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BHMTQ93088 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BHMTQ93088 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
BHMTQ93088 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
BHMTQ93088 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BHMTQ93088 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
BHMTQ93088 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
BHMTQ93088 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BHMTQ93088 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
BHMTQ93088 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
BHMTQ93088 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
BHMTQ93088 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
BHMTQ93088 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
BHMTQ93088 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BHMTQ93088 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
BHMTQ93088 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
BHMTQ93088 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BHMTQ93088 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BHMTQ93088 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BHMTQ93088 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BHMTQ93088 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BHMTQ93088 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BHMTQ93088 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
BHMTQ93088 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
BHMTQ93088 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
BHMTQ93088 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BHMTQ93088 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BHMTQ93088 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BHMTQ93088 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
BHMTQ93088 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
BHMTQ93088 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BHMTQ93088 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BHMTQ93088 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
BHMTQ93088 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
BHMTQ93088 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
BHMTQ93088 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
BHMTQ93088 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
BHMTQ93088 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
BHMTQ93088 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
BHMTQ93088 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
BHMTQ93088 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
BHMTQ93088 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
BHMTQ93088 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
BHMTQ93088 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
BHMTQ93088 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
BHMTQ93088 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BHMTQ93088 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BHMTQ93088 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BHMTQ93088 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
BHMTQ93088 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
BHMTQ93088 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
BHMTQ93088 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
BHMTQ93088 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
BHMTQ93088 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
BHMTQ93088 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
BHMTQ93088 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
BHMTQ93088 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
BHMTQ93088 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
BHMTQ93088 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
BHMTQ93088 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
BHMTQ93088 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
BHMTQ93088 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
BHMTQ93088 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
BHMTQ93088 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
BHMTQ93088 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
BHMTQ93088 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
BHMTQ93088 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
BHMTQ93088 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
BHMTQ93088 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
BHMTQ93088 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
BHMTQ93088 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
BHMTQ93088 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
BHMTQ93088 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
BHMTQ93088 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
BHMTQ93088 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms