Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV44

TRIM41, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM41, humanhuman

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM41Q8WV44 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
TRIM41Q8WV44 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
TRIM41Q8WV44 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
TRIM41Q8WV44 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
TRIM41Q8WV44 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
TRIM41Q8WV44 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
TRIM41Q8WV44 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC29.89■■■□□ 2.38
TRIM41Q8WV44 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
TRIM41Q8WV44 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
TRIM41Q8WV44 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
TRIM41Q8WV44 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
TRIM41Q8WV44 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
TRIM41Q8WV44 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
TRIM41Q8WV44 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
TRIM41Q8WV44 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
TRIM41Q8WV44 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
TRIM41Q8WV44 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
TRIM41Q8WV44 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
TRIM41Q8WV44 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
TRIM41Q8WV44 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
TRIM41Q8WV44 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
TRIM41Q8WV44 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
TRIM41Q8WV44 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
TRIM41Q8WV44 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
TRIM41Q8WV44 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.37
TRIM41Q8WV44 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
TRIM41Q8WV44 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC29.89■■■□□ 2.37
TRIM41Q8WV44 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
TRIM41Q8WV44 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
TRIM41Q8WV44 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
TRIM41Q8WV44 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
TRIM41Q8WV44 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
TRIM41Q8WV44 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
TRIM41Q8WV44 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC29.88■■■□□ 2.37
TRIM41Q8WV44 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
TRIM41Q8WV44 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
TRIM41Q8WV44 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC29.88■■■□□ 2.37
TRIM41Q8WV44 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
TRIM41Q8WV44 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
TRIM41Q8WV44 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
TRIM41Q8WV44 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
TRIM41Q8WV44 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
TRIM41Q8WV44 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
TRIM41Q8WV44 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
TRIM41Q8WV44 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
TRIM41Q8WV44 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC29.87■■■□□ 2.37
TRIM41Q8WV44 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
TRIM41Q8WV44 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
TRIM41Q8WV44 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
TRIM41Q8WV44 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
TRIM41Q8WV44 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
TRIM41Q8WV44 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
TRIM41Q8WV44 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
TRIM41Q8WV44 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
TRIM41Q8WV44 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
TRIM41Q8WV44 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC29.86■■■□□ 2.37
TRIM41Q8WV44 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
TRIM41Q8WV44 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
TRIM41Q8WV44 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
TRIM41Q8WV44 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
TRIM41Q8WV44 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
TRIM41Q8WV44 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
TRIM41Q8WV44 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
TRIM41Q8WV44 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
TRIM41Q8WV44 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
TRIM41Q8WV44 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
TRIM41Q8WV44 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
TRIM41Q8WV44 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
TRIM41Q8WV44 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
TRIM41Q8WV44 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
TRIM41Q8WV44 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
TRIM41Q8WV44 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
TRIM41Q8WV44 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
TRIM41Q8WV44 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
TRIM41Q8WV44 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
TRIM41Q8WV44 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
TRIM41Q8WV44 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
TRIM41Q8WV44 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
TRIM41Q8WV44 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
TRIM41Q8WV44 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
TRIM41Q8WV44 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
TRIM41Q8WV44 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
TRIM41Q8WV44 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
TRIM41Q8WV44 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
TRIM41Q8WV44 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
TRIM41Q8WV44 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
TRIM41Q8WV44 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
TRIM41Q8WV44 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
TRIM41Q8WV44 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
TRIM41Q8WV44 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
TRIM41Q8WV44 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
TRIM41Q8WV44 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
TRIM41Q8WV44 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
TRIM41Q8WV44 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
TRIM41Q8WV44 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
TRIM41Q8WV44 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
TRIM41Q8WV44 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
TRIM41Q8WV44 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
TRIM41Q8WV44 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
TRIM41Q8WV44 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms