Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUD4

CCDC12, Coiled-coil domain-containing protein 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC12Q8WUD4 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC12Q8WUD4 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC12Q8WUD4 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC12Q8WUD4 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC12Q8WUD4 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC12Q8WUD4 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC12Q8WUD4 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC12Q8WUD4 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC12Q8WUD4 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC12Q8WUD4 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC12Q8WUD4 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC12Q8WUD4 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC12Q8WUD4 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC12Q8WUD4 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC12Q8WUD4 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC12Q8WUD4 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC12Q8WUD4 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC12Q8WUD4 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC12Q8WUD4 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC12Q8WUD4 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC12Q8WUD4 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC12Q8WUD4 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC12Q8WUD4 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC12Q8WUD4 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC12Q8WUD4 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC12Q8WUD4 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC12Q8WUD4 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC12Q8WUD4 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC12Q8WUD4 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC12Q8WUD4 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC12Q8WUD4 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC12Q8WUD4 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC12Q8WUD4 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC12Q8WUD4 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC12Q8WUD4 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC12Q8WUD4 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC12Q8WUD4 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC12Q8WUD4 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC12Q8WUD4 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC12Q8WUD4 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC12Q8WUD4 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC12Q8WUD4 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC12Q8WUD4 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC12Q8WUD4 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC12Q8WUD4 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC12Q8WUD4 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC12Q8WUD4 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC12Q8WUD4 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC12Q8WUD4 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC12Q8WUD4 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC12Q8WUD4 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC12Q8WUD4 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC12Q8WUD4 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC12Q8WUD4 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC12Q8WUD4 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC12Q8WUD4 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC12Q8WUD4 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC12Q8WUD4 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC12Q8WUD4 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC12Q8WUD4 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC12Q8WUD4 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC12Q8WUD4 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC12Q8WUD4 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC12Q8WUD4 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC12Q8WUD4 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC12Q8WUD4 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC12Q8WUD4 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC12Q8WUD4 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC12Q8WUD4 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC12Q8WUD4 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC12Q8WUD4 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC12Q8WUD4 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC12Q8WUD4 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC12Q8WUD4 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC12Q8WUD4 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC12Q8WUD4 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC12Q8WUD4 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC12Q8WUD4 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC12Q8WUD4 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC12Q8WUD4 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC12Q8WUD4 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC12Q8WUD4 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC12Q8WUD4 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC12Q8WUD4 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC12Q8WUD4 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC12Q8WUD4 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC12Q8WUD4 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC12Q8WUD4 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC12Q8WUD4 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC12Q8WUD4 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC12Q8WUD4 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC12Q8WUD4 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC12Q8WUD4 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC12Q8WUD4 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC12Q8WUD4 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC12Q8WUD4 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC12Q8WUD4 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC12Q8WUD4 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC12Q8WUD4 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC12Q8WUD4 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms