Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFU0

BEST4, Bestrophin-4, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEST4Q8NFU0 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BEST4Q8NFU0 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BEST4Q8NFU0 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BEST4Q8NFU0 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BEST4Q8NFU0 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BEST4Q8NFU0 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BEST4Q8NFU0 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BEST4Q8NFU0 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BEST4Q8NFU0 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BEST4Q8NFU0 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BEST4Q8NFU0 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BEST4Q8NFU0 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BEST4Q8NFU0 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BEST4Q8NFU0 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BEST4Q8NFU0 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BEST4Q8NFU0 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BEST4Q8NFU0 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BEST4Q8NFU0 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BEST4Q8NFU0 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BEST4Q8NFU0 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BEST4Q8NFU0 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BEST4Q8NFU0 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BEST4Q8NFU0 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BEST4Q8NFU0 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BEST4Q8NFU0 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BEST4Q8NFU0 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BEST4Q8NFU0 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BEST4Q8NFU0 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BEST4Q8NFU0 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BEST4Q8NFU0 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BEST4Q8NFU0 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BEST4Q8NFU0 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BEST4Q8NFU0 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BEST4Q8NFU0 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BEST4Q8NFU0 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BEST4Q8NFU0 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BEST4Q8NFU0 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BEST4Q8NFU0 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BEST4Q8NFU0 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BEST4Q8NFU0 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BEST4Q8NFU0 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BEST4Q8NFU0 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BEST4Q8NFU0 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BEST4Q8NFU0 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BEST4Q8NFU0 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BEST4Q8NFU0 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BEST4Q8NFU0 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BEST4Q8NFU0 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BEST4Q8NFU0 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BEST4Q8NFU0 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BEST4Q8NFU0 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BEST4Q8NFU0 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BEST4Q8NFU0 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BEST4Q8NFU0 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BEST4Q8NFU0 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BEST4Q8NFU0 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BEST4Q8NFU0 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BEST4Q8NFU0 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BEST4Q8NFU0 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BEST4Q8NFU0 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BEST4Q8NFU0 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BEST4Q8NFU0 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BEST4Q8NFU0 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BEST4Q8NFU0 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BEST4Q8NFU0 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BEST4Q8NFU0 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BEST4Q8NFU0 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BEST4Q8NFU0 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BEST4Q8NFU0 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BEST4Q8NFU0 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BEST4Q8NFU0 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BEST4Q8NFU0 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BEST4Q8NFU0 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BEST4Q8NFU0 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
BEST4Q8NFU0 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BEST4Q8NFU0 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BEST4Q8NFU0 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BEST4Q8NFU0 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BEST4Q8NFU0 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BEST4Q8NFU0 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BEST4Q8NFU0 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BEST4Q8NFU0 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BEST4Q8NFU0 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BEST4Q8NFU0 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BEST4Q8NFU0 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BEST4Q8NFU0 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BEST4Q8NFU0 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
BEST4Q8NFU0 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BEST4Q8NFU0 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BEST4Q8NFU0 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BEST4Q8NFU0 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BEST4Q8NFU0 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BEST4Q8NFU0 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BEST4Q8NFU0 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BEST4Q8NFU0 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BEST4Q8NFU0 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BEST4Q8NFU0 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BEST4Q8NFU0 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BEST4Q8NFU0 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BEST4Q8NFU0 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms