Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6Q1

TMCO5A, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 5A, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCO5AQ8N6Q1 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMCO5AQ8N6Q1 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMCO5AQ8N6Q1 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMCO5AQ8N6Q1 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMCO5AQ8N6Q1 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMCO5AQ8N6Q1 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMCO5AQ8N6Q1 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMCO5AQ8N6Q1 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMCO5AQ8N6Q1 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMCO5AQ8N6Q1 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMCO5AQ8N6Q1 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMCO5AQ8N6Q1 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMCO5AQ8N6Q1 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMCO5AQ8N6Q1 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMCO5AQ8N6Q1 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMCO5AQ8N6Q1 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMCO5AQ8N6Q1 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMCO5AQ8N6Q1 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMCO5AQ8N6Q1 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMCO5AQ8N6Q1 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMCO5AQ8N6Q1 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMCO5AQ8N6Q1 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMCO5AQ8N6Q1 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMCO5AQ8N6Q1 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMCO5AQ8N6Q1 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMCO5AQ8N6Q1 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TMCO5AQ8N6Q1 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMCO5AQ8N6Q1 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMCO5AQ8N6Q1 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMCO5AQ8N6Q1 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMCO5AQ8N6Q1 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMCO5AQ8N6Q1 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMCO5AQ8N6Q1 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMCO5AQ8N6Q1 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TMCO5AQ8N6Q1 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMCO5AQ8N6Q1 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMCO5AQ8N6Q1 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMCO5AQ8N6Q1 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMCO5AQ8N6Q1 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMCO5AQ8N6Q1 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMCO5AQ8N6Q1 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMCO5AQ8N6Q1 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMCO5AQ8N6Q1 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMCO5AQ8N6Q1 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMCO5AQ8N6Q1 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
TMCO5AQ8N6Q1 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
TMCO5AQ8N6Q1 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
TMCO5AQ8N6Q1 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMCO5AQ8N6Q1 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMCO5AQ8N6Q1 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMCO5AQ8N6Q1 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TMCO5AQ8N6Q1 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMCO5AQ8N6Q1 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMCO5AQ8N6Q1 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMCO5AQ8N6Q1 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMCO5AQ8N6Q1 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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TMCO5AQ8N6Q1 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMCO5AQ8N6Q1 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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TMCO5AQ8N6Q1 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMCO5AQ8N6Q1 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMCO5AQ8N6Q1 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMCO5AQ8N6Q1 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
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TMCO5AQ8N6Q1 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMCO5AQ8N6Q1 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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TMCO5AQ8N6Q1 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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TMCO5AQ8N6Q1 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMCO5AQ8N6Q1 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
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TMCO5AQ8N6Q1 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMCO5AQ8N6Q1 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMCO5AQ8N6Q1 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TMCO5AQ8N6Q1 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMCO5AQ8N6Q1 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMCO5AQ8N6Q1 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMCO5AQ8N6Q1 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMCO5AQ8N6Q1 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMCO5AQ8N6Q1 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMCO5AQ8N6Q1 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMCO5AQ8N6Q1 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMCO5AQ8N6Q1 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMCO5AQ8N6Q1 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMCO5AQ8N6Q1 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMCO5AQ8N6Q1 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMCO5AQ8N6Q1 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMCO5AQ8N6Q1 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TMCO5AQ8N6Q1 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TMCO5AQ8N6Q1 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMCO5AQ8N6Q1 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMCO5AQ8N6Q1 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMCO5AQ8N6Q1 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMCO5AQ8N6Q1 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMCO5AQ8N6Q1 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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