Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6D2

RNF182, E3 ubiquitin-protein ligase RNF182, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF182Q8N6D2 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
RNF182Q8N6D2 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
RNF182Q8N6D2 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RNF182Q8N6D2 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
RNF182Q8N6D2 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
RNF182Q8N6D2 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
RNF182Q8N6D2 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
RNF182Q8N6D2 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
RNF182Q8N6D2 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
RNF182Q8N6D2 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RNF182Q8N6D2 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
RNF182Q8N6D2 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
RNF182Q8N6D2 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
RNF182Q8N6D2 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RNF182Q8N6D2 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RNF182Q8N6D2 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RNF182Q8N6D2 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RNF182Q8N6D2 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RNF182Q8N6D2 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
RNF182Q8N6D2 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
RNF182Q8N6D2 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
RNF182Q8N6D2 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC13.37□□□□□ -0.27
RNF182Q8N6D2 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RNF182Q8N6D2 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
RNF182Q8N6D2 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC13.37□□□□□ -0.27
RNF182Q8N6D2 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
RNF182Q8N6D2 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC13.37□□□□□ -0.27
RNF182Q8N6D2 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RNF182Q8N6D2 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
RNF182Q8N6D2 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
RNF182Q8N6D2 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RNF182Q8N6D2 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RNF182Q8N6D2 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RNF182Q8N6D2 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RNF182Q8N6D2 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
RNF182Q8N6D2 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RNF182Q8N6D2 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RNF182Q8N6D2 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RNF182Q8N6D2 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RNF182Q8N6D2 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RNF182Q8N6D2 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RNF182Q8N6D2 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RNF182Q8N6D2 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RNF182Q8N6D2 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RNF182Q8N6D2 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
RNF182Q8N6D2 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RNF182Q8N6D2 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RNF182Q8N6D2 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RNF182Q8N6D2 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RNF182Q8N6D2 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RNF182Q8N6D2 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RNF182Q8N6D2 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RNF182Q8N6D2 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RNF182Q8N6D2 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RNF182Q8N6D2 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RNF182Q8N6D2 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RNF182Q8N6D2 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RNF182Q8N6D2 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RNF182Q8N6D2 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RNF182Q8N6D2 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RNF182Q8N6D2 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RNF182Q8N6D2 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RNF182Q8N6D2 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RNF182Q8N6D2 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RNF182Q8N6D2 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
RNF182Q8N6D2 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RNF182Q8N6D2 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RNF182Q8N6D2 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RNF182Q8N6D2 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RNF182Q8N6D2 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RNF182Q8N6D2 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
RNF182Q8N6D2 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RNF182Q8N6D2 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RNF182Q8N6D2 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RNF182Q8N6D2 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RNF182Q8N6D2 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RNF182Q8N6D2 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
RNF182Q8N6D2 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RNF182Q8N6D2 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RNF182Q8N6D2 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RNF182Q8N6D2 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RNF182Q8N6D2 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RNF182Q8N6D2 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RNF182Q8N6D2 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RNF182Q8N6D2 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RNF182Q8N6D2 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RNF182Q8N6D2 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RNF182Q8N6D2 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RNF182Q8N6D2 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RNF182Q8N6D2 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RNF182Q8N6D2 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RNF182Q8N6D2 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RNF182Q8N6D2 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RNF182Q8N6D2 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RNF182Q8N6D2 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RNF182Q8N6D2 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RNF182Q8N6D2 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RNF182Q8N6D2 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RNF182Q8N6D2 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
RNF182Q8N6D2 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms