Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXH8

CCBE1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCBE1Q6UXH8 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCBE1Q6UXH8 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCBE1Q6UXH8 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCBE1Q6UXH8 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCBE1Q6UXH8 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCBE1Q6UXH8 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CCBE1Q6UXH8 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCBE1Q6UXH8 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCBE1Q6UXH8 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCBE1Q6UXH8 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CCBE1Q6UXH8 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CCBE1Q6UXH8 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCBE1Q6UXH8 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCBE1Q6UXH8 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCBE1Q6UXH8 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCBE1Q6UXH8 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CCBE1Q6UXH8 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCBE1Q6UXH8 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCBE1Q6UXH8 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CCBE1Q6UXH8 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCBE1Q6UXH8 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCBE1Q6UXH8 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCBE1Q6UXH8 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCBE1Q6UXH8 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCBE1Q6UXH8 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCBE1Q6UXH8 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCBE1Q6UXH8 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCBE1Q6UXH8 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCBE1Q6UXH8 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCBE1Q6UXH8 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCBE1Q6UXH8 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCBE1Q6UXH8 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCBE1Q6UXH8 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCBE1Q6UXH8 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCBE1Q6UXH8 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCBE1Q6UXH8 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCBE1Q6UXH8 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCBE1Q6UXH8 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCBE1Q6UXH8 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCBE1Q6UXH8 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCBE1Q6UXH8 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCBE1Q6UXH8 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCBE1Q6UXH8 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCBE1Q6UXH8 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCBE1Q6UXH8 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCBE1Q6UXH8 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCBE1Q6UXH8 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCBE1Q6UXH8 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCBE1Q6UXH8 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCBE1Q6UXH8 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCBE1Q6UXH8 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CCBE1Q6UXH8 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCBE1Q6UXH8 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCBE1Q6UXH8 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCBE1Q6UXH8 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCBE1Q6UXH8 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCBE1Q6UXH8 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCBE1Q6UXH8 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCBE1Q6UXH8 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCBE1Q6UXH8 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCBE1Q6UXH8 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCBE1Q6UXH8 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCBE1Q6UXH8 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CCBE1Q6UXH8 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCBE1Q6UXH8 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCBE1Q6UXH8 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCBE1Q6UXH8 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCBE1Q6UXH8 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCBE1Q6UXH8 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCBE1Q6UXH8 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCBE1Q6UXH8 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCBE1Q6UXH8 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCBE1Q6UXH8 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCBE1Q6UXH8 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCBE1Q6UXH8 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCBE1Q6UXH8 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCBE1Q6UXH8 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCBE1Q6UXH8 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCBE1Q6UXH8 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCBE1Q6UXH8 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCBE1Q6UXH8 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CCBE1Q6UXH8 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCBE1Q6UXH8 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCBE1Q6UXH8 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCBE1Q6UXH8 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCBE1Q6UXH8 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCBE1Q6UXH8 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCBE1Q6UXH8 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCBE1Q6UXH8 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCBE1Q6UXH8 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCBE1Q6UXH8 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CCBE1Q6UXH8 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCBE1Q6UXH8 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CCBE1Q6UXH8 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCBE1Q6UXH8 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCBE1Q6UXH8 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCBE1Q6UXH8 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCBE1Q6UXH8 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCBE1Q6UXH8 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCBE1Q6UXH8 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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