Protein–RNA interactions for Protein: Q6PII3

CCDC174, Coiled-coil domain-containing protein 174, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC174Q6PII3 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC174Q6PII3 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC174Q6PII3 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC174Q6PII3 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC174Q6PII3 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC174Q6PII3 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC174Q6PII3 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC174Q6PII3 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC174Q6PII3 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC174Q6PII3 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC174Q6PII3 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC174Q6PII3 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC174Q6PII3 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC174Q6PII3 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC174Q6PII3 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC174Q6PII3 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC174Q6PII3 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC174Q6PII3 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC174Q6PII3 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC174Q6PII3 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC174Q6PII3 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC174Q6PII3 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC174Q6PII3 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC174Q6PII3 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC174Q6PII3 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC174Q6PII3 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC174Q6PII3 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC174Q6PII3 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC174Q6PII3 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC174Q6PII3 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC174Q6PII3 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC174Q6PII3 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC174Q6PII3 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC174Q6PII3 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC174Q6PII3 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC174Q6PII3 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC174Q6PII3 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC174Q6PII3 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC174Q6PII3 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC174Q6PII3 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC174Q6PII3 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC174Q6PII3 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC174Q6PII3 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC174Q6PII3 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC174Q6PII3 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC174Q6PII3 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC174Q6PII3 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC174Q6PII3 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC174Q6PII3 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC174Q6PII3 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC174Q6PII3 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC174Q6PII3 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC174Q6PII3 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC174Q6PII3 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC174Q6PII3 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC174Q6PII3 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC174Q6PII3 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC174Q6PII3 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC174Q6PII3 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC174Q6PII3 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC174Q6PII3 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC174Q6PII3 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC174Q6PII3 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC174Q6PII3 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC174Q6PII3 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC174Q6PII3 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC174Q6PII3 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC174Q6PII3 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC174Q6PII3 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC174Q6PII3 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC174Q6PII3 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC174Q6PII3 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC174Q6PII3 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC174Q6PII3 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC174Q6PII3 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC174Q6PII3 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC174Q6PII3 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC174Q6PII3 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC174Q6PII3 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC174Q6PII3 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC174Q6PII3 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC174Q6PII3 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC174Q6PII3 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC174Q6PII3 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC174Q6PII3 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC174Q6PII3 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC174Q6PII3 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC174Q6PII3 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC174Q6PII3 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC174Q6PII3 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC174Q6PII3 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC174Q6PII3 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC174Q6PII3 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC174Q6PII3 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC174Q6PII3 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC174Q6PII3 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC174Q6PII3 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC174Q6PII3 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC174Q6PII3 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC174Q6PII3 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms