Protein–RNA interactions for Protein: Q5QJU3

ACER2, Alkaline ceramidase 2, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACER2Q5QJU3 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACER2Q5QJU3 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACER2Q5QJU3 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACER2Q5QJU3 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACER2Q5QJU3 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACER2Q5QJU3 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACER2Q5QJU3 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACER2Q5QJU3 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACER2Q5QJU3 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACER2Q5QJU3 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACER2Q5QJU3 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACER2Q5QJU3 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACER2Q5QJU3 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACER2Q5QJU3 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACER2Q5QJU3 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACER2Q5QJU3 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACER2Q5QJU3 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACER2Q5QJU3 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACER2Q5QJU3 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACER2Q5QJU3 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACER2Q5QJU3 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACER2Q5QJU3 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACER2Q5QJU3 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACER2Q5QJU3 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACER2Q5QJU3 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ACER2Q5QJU3 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACER2Q5QJU3 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ACER2Q5QJU3 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACER2Q5QJU3 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACER2Q5QJU3 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACER2Q5QJU3 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACER2Q5QJU3 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACER2Q5QJU3 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ACER2Q5QJU3 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACER2Q5QJU3 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ACER2Q5QJU3 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ACER2Q5QJU3 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACER2Q5QJU3 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACER2Q5QJU3 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACER2Q5QJU3 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACER2Q5QJU3 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACER2Q5QJU3 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACER2Q5QJU3 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACER2Q5QJU3 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACER2Q5QJU3 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACER2Q5QJU3 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACER2Q5QJU3 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACER2Q5QJU3 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACER2Q5QJU3 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACER2Q5QJU3 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACER2Q5QJU3 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACER2Q5QJU3 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACER2Q5QJU3 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACER2Q5QJU3 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ACER2Q5QJU3 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACER2Q5QJU3 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACER2Q5QJU3 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACER2Q5QJU3 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACER2Q5QJU3 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACER2Q5QJU3 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACER2Q5QJU3 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACER2Q5QJU3 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACER2Q5QJU3 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACER2Q5QJU3 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACER2Q5QJU3 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ACER2Q5QJU3 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACER2Q5QJU3 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACER2Q5QJU3 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACER2Q5QJU3 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACER2Q5QJU3 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACER2Q5QJU3 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACER2Q5QJU3 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACER2Q5QJU3 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACER2Q5QJU3 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACER2Q5QJU3 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACER2Q5QJU3 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACER2Q5QJU3 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACER2Q5QJU3 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACER2Q5QJU3 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACER2Q5QJU3 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACER2Q5QJU3 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACER2Q5QJU3 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACER2Q5QJU3 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACER2Q5QJU3 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACER2Q5QJU3 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACER2Q5QJU3 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACER2Q5QJU3 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACER2Q5QJU3 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ACER2Q5QJU3 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACER2Q5QJU3 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACER2Q5QJU3 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACER2Q5QJU3 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACER2Q5QJU3 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACER2Q5QJU3 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACER2Q5QJU3 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACER2Q5QJU3 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACER2Q5QJU3 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACER2Q5QJU3 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACER2Q5QJU3 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACER2Q5QJU3 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms