Protein–RNA interactions for Protein: Q56P42

PYDC2, Pyrin domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PYDC2Q56P42 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PYDC2Q56P42 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PYDC2Q56P42 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PYDC2Q56P42 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PYDC2Q56P42 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PYDC2Q56P42 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PYDC2Q56P42 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PYDC2Q56P42 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PYDC2Q56P42 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PYDC2Q56P42 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PYDC2Q56P42 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PYDC2Q56P42 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PYDC2Q56P42 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PYDC2Q56P42 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PYDC2Q56P42 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PYDC2Q56P42 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PYDC2Q56P42 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PYDC2Q56P42 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PYDC2Q56P42 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PYDC2Q56P42 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PYDC2Q56P42 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PYDC2Q56P42 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PYDC2Q56P42 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PYDC2Q56P42 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PYDC2Q56P42 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PYDC2Q56P42 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PYDC2Q56P42 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PYDC2Q56P42 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PYDC2Q56P42 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PYDC2Q56P42 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PYDC2Q56P42 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PYDC2Q56P42 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PYDC2Q56P42 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PYDC2Q56P42 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PYDC2Q56P42 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PYDC2Q56P42 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PYDC2Q56P42 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PYDC2Q56P42 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PYDC2Q56P42 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PYDC2Q56P42 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PYDC2Q56P42 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PYDC2Q56P42 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PYDC2Q56P42 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PYDC2Q56P42 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PYDC2Q56P42 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PYDC2Q56P42 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PYDC2Q56P42 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PYDC2Q56P42 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PYDC2Q56P42 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PYDC2Q56P42 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PYDC2Q56P42 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PYDC2Q56P42 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PYDC2Q56P42 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PYDC2Q56P42 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PYDC2Q56P42 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PYDC2Q56P42 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PYDC2Q56P42 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PYDC2Q56P42 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PYDC2Q56P42 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PYDC2Q56P42 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PYDC2Q56P42 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PYDC2Q56P42 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PYDC2Q56P42 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PYDC2Q56P42 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PYDC2Q56P42 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PYDC2Q56P42 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PYDC2Q56P42 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PYDC2Q56P42 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PYDC2Q56P42 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PYDC2Q56P42 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PYDC2Q56P42 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PYDC2Q56P42 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PYDC2Q56P42 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PYDC2Q56P42 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PYDC2Q56P42 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PYDC2Q56P42 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PYDC2Q56P42 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PYDC2Q56P42 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PYDC2Q56P42 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PYDC2Q56P42 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PYDC2Q56P42 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PYDC2Q56P42 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PYDC2Q56P42 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PYDC2Q56P42 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PYDC2Q56P42 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PYDC2Q56P42 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PYDC2Q56P42 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PYDC2Q56P42 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PYDC2Q56P42 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PYDC2Q56P42 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PYDC2Q56P42 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PYDC2Q56P42 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PYDC2Q56P42 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PYDC2Q56P42 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PYDC2Q56P42 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PYDC2Q56P42 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PYDC2Q56P42 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PYDC2Q56P42 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PYDC2Q56P42 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PYDC2Q56P42 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.9 ms