Protein–RNA interactions for Protein: Q16394

EXT1, Exostosin-1, humanhuman

Predictions only

Length 746 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXT1Q16394 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EXT1Q16394 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
EXT1Q16394 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EXT1Q16394 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EXT1Q16394 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EXT1Q16394 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EXT1Q16394 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EXT1Q16394 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
EXT1Q16394 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
EXT1Q16394 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
EXT1Q16394 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EXT1Q16394 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EXT1Q16394 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EXT1Q16394 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EXT1Q16394 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EXT1Q16394 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EXT1Q16394 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EXT1Q16394 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EXT1Q16394 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EXT1Q16394 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
EXT1Q16394 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EXT1Q16394 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EXT1Q16394 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EXT1Q16394 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EXT1Q16394 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EXT1Q16394 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EXT1Q16394 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EXT1Q16394 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EXT1Q16394 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EXT1Q16394 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
EXT1Q16394 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EXT1Q16394 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EXT1Q16394 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EXT1Q16394 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EXT1Q16394 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EXT1Q16394 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
EXT1Q16394 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EXT1Q16394 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EXT1Q16394 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EXT1Q16394 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EXT1Q16394 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EXT1Q16394 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EXT1Q16394 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EXT1Q16394 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EXT1Q16394 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EXT1Q16394 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EXT1Q16394 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
EXT1Q16394 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EXT1Q16394 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EXT1Q16394 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EXT1Q16394 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
EXT1Q16394 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EXT1Q16394 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EXT1Q16394 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EXT1Q16394 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EXT1Q16394 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EXT1Q16394 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EXT1Q16394 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EXT1Q16394 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EXT1Q16394 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EXT1Q16394 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EXT1Q16394 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EXT1Q16394 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EXT1Q16394 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EXT1Q16394 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EXT1Q16394 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EXT1Q16394 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EXT1Q16394 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EXT1Q16394 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EXT1Q16394 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EXT1Q16394 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EXT1Q16394 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EXT1Q16394 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EXT1Q16394 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EXT1Q16394 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EXT1Q16394 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EXT1Q16394 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
EXT1Q16394 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EXT1Q16394 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EXT1Q16394 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EXT1Q16394 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EXT1Q16394 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EXT1Q16394 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EXT1Q16394 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EXT1Q16394 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EXT1Q16394 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EXT1Q16394 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EXT1Q16394 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EXT1Q16394 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EXT1Q16394 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EXT1Q16394 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EXT1Q16394 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EXT1Q16394 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EXT1Q16394 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EXT1Q16394 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EXT1Q16394 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
EXT1Q16394 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EXT1Q16394 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EXT1Q16394 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EXT1Q16394 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms