Protein–RNA interactions for Protein: Q16048

PMCHL1, Putative pro-MCH-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 86 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMCHL1Q16048 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PMCHL1Q16048 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PMCHL1Q16048 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PMCHL1Q16048 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PMCHL1Q16048 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PMCHL1Q16048 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PMCHL1Q16048 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PMCHL1Q16048 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PMCHL1Q16048 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PMCHL1Q16048 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PMCHL1Q16048 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PMCHL1Q16048 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PMCHL1Q16048 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PMCHL1Q16048 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PMCHL1Q16048 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PMCHL1Q16048 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PMCHL1Q16048 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PMCHL1Q16048 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PMCHL1Q16048 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PMCHL1Q16048 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
PMCHL1Q16048 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PMCHL1Q16048 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PMCHL1Q16048 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PMCHL1Q16048 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PMCHL1Q16048 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PMCHL1Q16048 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PMCHL1Q16048 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PMCHL1Q16048 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PMCHL1Q16048 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PMCHL1Q16048 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PMCHL1Q16048 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PMCHL1Q16048 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PMCHL1Q16048 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PMCHL1Q16048 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PMCHL1Q16048 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PMCHL1Q16048 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PMCHL1Q16048 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PMCHL1Q16048 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PMCHL1Q16048 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PMCHL1Q16048 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PMCHL1Q16048 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PMCHL1Q16048 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PMCHL1Q16048 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PMCHL1Q16048 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PMCHL1Q16048 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PMCHL1Q16048 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PMCHL1Q16048 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PMCHL1Q16048 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PMCHL1Q16048 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PMCHL1Q16048 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PMCHL1Q16048 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PMCHL1Q16048 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PMCHL1Q16048 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PMCHL1Q16048 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PMCHL1Q16048 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PMCHL1Q16048 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PMCHL1Q16048 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PMCHL1Q16048 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PMCHL1Q16048 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PMCHL1Q16048 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
PMCHL1Q16048 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PMCHL1Q16048 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PMCHL1Q16048 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
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PMCHL1Q16048 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PMCHL1Q16048 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PMCHL1Q16048 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PMCHL1Q16048 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PMCHL1Q16048 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PMCHL1Q16048 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PMCHL1Q16048 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PMCHL1Q16048 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PMCHL1Q16048 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PMCHL1Q16048 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PMCHL1Q16048 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PMCHL1Q16048 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PMCHL1Q16048 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PMCHL1Q16048 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PMCHL1Q16048 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
PMCHL1Q16048 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PMCHL1Q16048 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PMCHL1Q16048 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
PMCHL1Q16048 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PMCHL1Q16048 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PMCHL1Q16048 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PMCHL1Q16048 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PMCHL1Q16048 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PMCHL1Q16048 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PMCHL1Q16048 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PMCHL1Q16048 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PMCHL1Q16048 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PMCHL1Q16048 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PMCHL1Q16048 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PMCHL1Q16048 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PMCHL1Q16048 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PMCHL1Q16048 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
PMCHL1Q16048 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PMCHL1Q16048 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PMCHL1Q16048 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
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