Protein–RNA interactions for Protein: Q15878

CACNA1E, Voltage-dependent R-type calcium channel subunit alpha-1E, humanhuman

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Length 2,313 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1EQ15878 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CACNA1EQ15878 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CACNA1EQ15878 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CACNA1EQ15878 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CACNA1EQ15878 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CACNA1EQ15878 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CACNA1EQ15878 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CACNA1EQ15878 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CACNA1EQ15878 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CACNA1EQ15878 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CACNA1EQ15878 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CACNA1EQ15878 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CACNA1EQ15878 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CACNA1EQ15878 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CACNA1EQ15878 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CACNA1EQ15878 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CACNA1EQ15878 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CACNA1EQ15878 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CACNA1EQ15878 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CACNA1EQ15878 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CACNA1EQ15878 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CACNA1EQ15878 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CACNA1EQ15878 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CACNA1EQ15878 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CACNA1EQ15878 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CACNA1EQ15878 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CACNA1EQ15878 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CACNA1EQ15878 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CACNA1EQ15878 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CACNA1EQ15878 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CACNA1EQ15878 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CACNA1EQ15878 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CACNA1EQ15878 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CACNA1EQ15878 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CACNA1EQ15878 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CACNA1EQ15878 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CACNA1EQ15878 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CACNA1EQ15878 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CACNA1EQ15878 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CACNA1EQ15878 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CACNA1EQ15878 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CACNA1EQ15878 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CACNA1EQ15878 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CACNA1EQ15878 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CACNA1EQ15878 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CACNA1EQ15878 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CACNA1EQ15878 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CACNA1EQ15878 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CACNA1EQ15878 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CACNA1EQ15878 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CACNA1EQ15878 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CACNA1EQ15878 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CACNA1EQ15878 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CACNA1EQ15878 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CACNA1EQ15878 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CACNA1EQ15878 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CACNA1EQ15878 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CACNA1EQ15878 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CACNA1EQ15878 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CACNA1EQ15878 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CACNA1EQ15878 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CACNA1EQ15878 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CACNA1EQ15878 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CACNA1EQ15878 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CACNA1EQ15878 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CACNA1EQ15878 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CACNA1EQ15878 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CACNA1EQ15878 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CACNA1EQ15878 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CACNA1EQ15878 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CACNA1EQ15878 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CACNA1EQ15878 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CACNA1EQ15878 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CACNA1EQ15878 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CACNA1EQ15878 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CACNA1EQ15878 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CACNA1EQ15878 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CACNA1EQ15878 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CACNA1EQ15878 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CACNA1EQ15878 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CACNA1EQ15878 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CACNA1EQ15878 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CACNA1EQ15878 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CACNA1EQ15878 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CACNA1EQ15878 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CACNA1EQ15878 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CACNA1EQ15878 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CACNA1EQ15878 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CACNA1EQ15878 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CACNA1EQ15878 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CACNA1EQ15878 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CACNA1EQ15878 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CACNA1EQ15878 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CACNA1EQ15878 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CACNA1EQ15878 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CACNA1EQ15878 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
CACNA1EQ15878 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
CACNA1EQ15878 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CACNA1EQ15878 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CACNA1EQ15878 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
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