Protein–RNA interactions for Protein: Q15642

TRIP10, Cdc42-interacting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 601 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP10Q15642 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRIP10Q15642 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRIP10Q15642 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRIP10Q15642 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRIP10Q15642 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRIP10Q15642 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRIP10Q15642 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRIP10Q15642 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRIP10Q15642 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
TRIP10Q15642 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRIP10Q15642 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRIP10Q15642 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRIP10Q15642 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRIP10Q15642 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRIP10Q15642 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRIP10Q15642 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRIP10Q15642 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRIP10Q15642 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRIP10Q15642 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRIP10Q15642 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRIP10Q15642 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRIP10Q15642 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRIP10Q15642 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRIP10Q15642 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRIP10Q15642 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRIP10Q15642 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRIP10Q15642 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRIP10Q15642 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRIP10Q15642 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRIP10Q15642 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRIP10Q15642 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRIP10Q15642 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRIP10Q15642 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRIP10Q15642 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRIP10Q15642 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRIP10Q15642 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRIP10Q15642 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRIP10Q15642 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRIP10Q15642 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRIP10Q15642 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRIP10Q15642 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRIP10Q15642 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRIP10Q15642 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRIP10Q15642 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRIP10Q15642 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRIP10Q15642 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRIP10Q15642 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRIP10Q15642 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRIP10Q15642 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRIP10Q15642 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRIP10Q15642 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRIP10Q15642 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRIP10Q15642 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRIP10Q15642 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRIP10Q15642 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRIP10Q15642 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRIP10Q15642 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRIP10Q15642 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRIP10Q15642 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRIP10Q15642 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRIP10Q15642 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRIP10Q15642 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
TRIP10Q15642 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
TRIP10Q15642 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRIP10Q15642 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRIP10Q15642 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRIP10Q15642 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
TRIP10Q15642 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
TRIP10Q15642 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
TRIP10Q15642 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRIP10Q15642 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRIP10Q15642 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRIP10Q15642 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRIP10Q15642 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRIP10Q15642 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRIP10Q15642 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRIP10Q15642 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRIP10Q15642 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRIP10Q15642 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRIP10Q15642 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRIP10Q15642 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRIP10Q15642 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRIP10Q15642 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRIP10Q15642 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRIP10Q15642 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRIP10Q15642 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRIP10Q15642 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRIP10Q15642 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRIP10Q15642 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRIP10Q15642 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRIP10Q15642 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRIP10Q15642 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRIP10Q15642 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRIP10Q15642 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRIP10Q15642 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRIP10Q15642 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRIP10Q15642 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRIP10Q15642 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
TRIP10Q15642 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRIP10Q15642 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms