Protein–RNA interactions for Protein: Q15628

TRADD, Tumor necrosis factor receptor type 1-associated DEATH domain protein, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRADDQ15628 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRADDQ15628 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRADDQ15628 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRADDQ15628 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRADDQ15628 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRADDQ15628 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRADDQ15628 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRADDQ15628 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRADDQ15628 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRADDQ15628 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRADDQ15628 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRADDQ15628 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRADDQ15628 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRADDQ15628 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRADDQ15628 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRADDQ15628 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRADDQ15628 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
TRADDQ15628 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
TRADDQ15628 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
TRADDQ15628 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
TRADDQ15628 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
TRADDQ15628 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRADDQ15628 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRADDQ15628 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRADDQ15628 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRADDQ15628 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRADDQ15628 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
TRADDQ15628 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRADDQ15628 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRADDQ15628 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRADDQ15628 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRADDQ15628 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRADDQ15628 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRADDQ15628 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRADDQ15628 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRADDQ15628 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRADDQ15628 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
TRADDQ15628 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
TRADDQ15628 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
TRADDQ15628 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
TRADDQ15628 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
TRADDQ15628 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
TRADDQ15628 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
TRADDQ15628 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRADDQ15628 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRADDQ15628 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRADDQ15628 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRADDQ15628 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRADDQ15628 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRADDQ15628 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRADDQ15628 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRADDQ15628 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRADDQ15628 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRADDQ15628 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
TRADDQ15628 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRADDQ15628 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRADDQ15628 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRADDQ15628 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRADDQ15628 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRADDQ15628 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRADDQ15628 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRADDQ15628 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
TRADDQ15628 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
TRADDQ15628 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
TRADDQ15628 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRADDQ15628 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRADDQ15628 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRADDQ15628 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRADDQ15628 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRADDQ15628 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRADDQ15628 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRADDQ15628 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRADDQ15628 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRADDQ15628 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRADDQ15628 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRADDQ15628 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRADDQ15628 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRADDQ15628 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRADDQ15628 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRADDQ15628 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
TRADDQ15628 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRADDQ15628 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRADDQ15628 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRADDQ15628 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRADDQ15628 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
TRADDQ15628 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRADDQ15628 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRADDQ15628 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
TRADDQ15628 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
TRADDQ15628 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRADDQ15628 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRADDQ15628 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRADDQ15628 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRADDQ15628 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRADDQ15628 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRADDQ15628 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRADDQ15628 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRADDQ15628 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRADDQ15628 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRADDQ15628 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
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