Protein–RNA interactions for Protein: Q14993

COL19A1, Collagen alpha-1(XIX) chain, humanhuman

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Length 1,142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL19A1Q14993 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
COL19A1Q14993 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
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COL19A1Q14993 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
COL19A1Q14993 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
COL19A1Q14993 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
COL19A1Q14993 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
COL19A1Q14993 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
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COL19A1Q14993 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
COL19A1Q14993 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
COL19A1Q14993 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
COL19A1Q14993 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
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COL19A1Q14993 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
COL19A1Q14993 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
COL19A1Q14993 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
COL19A1Q14993 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
COL19A1Q14993 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
COL19A1Q14993 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
COL19A1Q14993 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
COL19A1Q14993 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
COL19A1Q14993 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
COL19A1Q14993 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
COL19A1Q14993 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
COL19A1Q14993 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
COL19A1Q14993 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
COL19A1Q14993 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
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COL19A1Q14993 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
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COL19A1Q14993 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
COL19A1Q14993 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
COL19A1Q14993 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
COL19A1Q14993 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
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COL19A1Q14993 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
COL19A1Q14993 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
COL19A1Q14993 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
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COL19A1Q14993 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
COL19A1Q14993 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
COL19A1Q14993 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
COL19A1Q14993 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
COL19A1Q14993 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
COL19A1Q14993 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
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COL19A1Q14993 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
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COL19A1Q14993 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
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COL19A1Q14993 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
COL19A1Q14993 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
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COL19A1Q14993 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
COL19A1Q14993 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
COL19A1Q14993 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
COL19A1Q14993 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
COL19A1Q14993 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
COL19A1Q14993 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
COL19A1Q14993 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
COL19A1Q14993 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
COL19A1Q14993 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
COL19A1Q14993 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
COL19A1Q14993 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
COL19A1Q14993 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
COL19A1Q14993 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
COL19A1Q14993 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
COL19A1Q14993 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
COL19A1Q14993 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
COL19A1Q14993 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
COL19A1Q14993 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
COL19A1Q14993 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
COL19A1Q14993 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
COL19A1Q14993 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
COL19A1Q14993 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
COL19A1Q14993 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
COL19A1Q14993 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
COL19A1Q14993 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
COL19A1Q14993 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
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