Protein–RNA interactions for Protein: Q14956

GPNMB, Transmembrane glycoprotein NMB, humanhuman

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Length 572 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPNMBQ14956 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GPNMBQ14956 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GPNMBQ14956 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GPNMBQ14956 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GPNMBQ14956 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GPNMBQ14956 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GPNMBQ14956 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GPNMBQ14956 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GPNMBQ14956 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GPNMBQ14956 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GPNMBQ14956 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GPNMBQ14956 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GPNMBQ14956 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GPNMBQ14956 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GPNMBQ14956 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GPNMBQ14956 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GPNMBQ14956 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GPNMBQ14956 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GPNMBQ14956 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
GPNMBQ14956 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GPNMBQ14956 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GPNMBQ14956 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GPNMBQ14956 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
GPNMBQ14956 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GPNMBQ14956 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GPNMBQ14956 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
GPNMBQ14956 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GPNMBQ14956 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GPNMBQ14956 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
GPNMBQ14956 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GPNMBQ14956 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GPNMBQ14956 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GPNMBQ14956 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GPNMBQ14956 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GPNMBQ14956 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GPNMBQ14956 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GPNMBQ14956 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GPNMBQ14956 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GPNMBQ14956 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GPNMBQ14956 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GPNMBQ14956 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GPNMBQ14956 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GPNMBQ14956 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GPNMBQ14956 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GPNMBQ14956 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GPNMBQ14956 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
GPNMBQ14956 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GPNMBQ14956 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GPNMBQ14956 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GPNMBQ14956 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GPNMBQ14956 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GPNMBQ14956 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GPNMBQ14956 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GPNMBQ14956 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GPNMBQ14956 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
GPNMBQ14956 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
GPNMBQ14956 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
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GPNMBQ14956 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GPNMBQ14956 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
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GPNMBQ14956 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GPNMBQ14956 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GPNMBQ14956 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GPNMBQ14956 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GPNMBQ14956 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GPNMBQ14956 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GPNMBQ14956 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GPNMBQ14956 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GPNMBQ14956 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GPNMBQ14956 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GPNMBQ14956 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GPNMBQ14956 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GPNMBQ14956 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GPNMBQ14956 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GPNMBQ14956 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GPNMBQ14956 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GPNMBQ14956 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GPNMBQ14956 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GPNMBQ14956 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GPNMBQ14956 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GPNMBQ14956 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GPNMBQ14956 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GPNMBQ14956 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GPNMBQ14956 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GPNMBQ14956 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GPNMBQ14956 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
GPNMBQ14956 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GPNMBQ14956 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GPNMBQ14956 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
GPNMBQ14956 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GPNMBQ14956 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
GPNMBQ14956 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
GPNMBQ14956 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GPNMBQ14956 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GPNMBQ14956 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
GPNMBQ14956 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GPNMBQ14956 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GPNMBQ14956 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GPNMBQ14956 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
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