Protein–RNA interactions for Protein: Q14457

BECN1, Beclin-1, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BECN1Q14457 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
BECN1Q14457 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
BECN1Q14457 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
BECN1Q14457 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
BECN1Q14457 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
BECN1Q14457 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
BECN1Q14457 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
BECN1Q14457 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
BECN1Q14457 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
BECN1Q14457 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
BECN1Q14457 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
BECN1Q14457 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
BECN1Q14457 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
BECN1Q14457 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
BECN1Q14457 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
BECN1Q14457 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
BECN1Q14457 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
BECN1Q14457 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
BECN1Q14457 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
BECN1Q14457 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
BECN1Q14457 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
BECN1Q14457 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
BECN1Q14457 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
BECN1Q14457 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
BECN1Q14457 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
BECN1Q14457 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
BECN1Q14457 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
BECN1Q14457 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
BECN1Q14457 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
BECN1Q14457 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
BECN1Q14457 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
BECN1Q14457 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
BECN1Q14457 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
BECN1Q14457 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
BECN1Q14457 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
BECN1Q14457 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
BECN1Q14457 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
BECN1Q14457 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
BECN1Q14457 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
BECN1Q14457 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
BECN1Q14457 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
BECN1Q14457 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
BECN1Q14457 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
BECN1Q14457 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
BECN1Q14457 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
BECN1Q14457 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
BECN1Q14457 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
BECN1Q14457 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
BECN1Q14457 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
BECN1Q14457 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
BECN1Q14457 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
BECN1Q14457 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
BECN1Q14457 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
BECN1Q14457 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
BECN1Q14457 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
BECN1Q14457 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
BECN1Q14457 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
BECN1Q14457 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
BECN1Q14457 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
BECN1Q14457 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
BECN1Q14457 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
BECN1Q14457 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
BECN1Q14457 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
BECN1Q14457 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
BECN1Q14457 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
BECN1Q14457 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
BECN1Q14457 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
BECN1Q14457 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
BECN1Q14457 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
BECN1Q14457 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
BECN1Q14457 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
BECN1Q14457 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
BECN1Q14457 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
BECN1Q14457 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
BECN1Q14457 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
BECN1Q14457 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
BECN1Q14457 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
BECN1Q14457 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
BECN1Q14457 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
BECN1Q14457 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
BECN1Q14457 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
BECN1Q14457 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
BECN1Q14457 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
BECN1Q14457 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
BECN1Q14457 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
BECN1Q14457 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
BECN1Q14457 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
BECN1Q14457 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
BECN1Q14457 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
BECN1Q14457 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
BECN1Q14457 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
BECN1Q14457 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
BECN1Q14457 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
BECN1Q14457 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
BECN1Q14457 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
BECN1Q14457 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
BECN1Q14457 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
BECN1Q14457 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
BECN1Q14457 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
BECN1Q14457 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
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