Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
APOFQ13790 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
APOFQ13790 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
APOFQ13790 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
APOFQ13790 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
APOFQ13790 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
APOFQ13790 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
APOFQ13790 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
APOFQ13790 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
APOFQ13790 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
APOFQ13790 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
APOFQ13790 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
APOFQ13790 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
APOFQ13790 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
APOFQ13790 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
APOFQ13790 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
APOFQ13790 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
APOFQ13790 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
APOFQ13790 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
APOFQ13790 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
APOFQ13790 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
APOFQ13790 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
APOFQ13790 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
APOFQ13790 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
APOFQ13790 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
APOFQ13790 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
APOFQ13790 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
APOFQ13790 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
APOFQ13790 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
APOFQ13790 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
APOFQ13790 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
APOFQ13790 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
APOFQ13790 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
APOFQ13790 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
APOFQ13790 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
APOFQ13790 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
APOFQ13790 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
APOFQ13790 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
APOFQ13790 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
APOFQ13790 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
APOFQ13790 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
APOFQ13790 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
APOFQ13790 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
APOFQ13790 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
APOFQ13790 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
APOFQ13790 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
APOFQ13790 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
APOFQ13790 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
APOFQ13790 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
APOFQ13790 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
APOFQ13790 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
APOFQ13790 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
APOFQ13790 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
APOFQ13790 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
APOFQ13790 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
APOFQ13790 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
APOFQ13790 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
APOFQ13790 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
APOFQ13790 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
APOFQ13790 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
APOFQ13790 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
APOFQ13790 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
APOFQ13790 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
APOFQ13790 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
APOFQ13790 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
APOFQ13790 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
APOFQ13790 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
APOFQ13790 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
APOFQ13790 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
APOFQ13790 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
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APOFQ13790 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
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APOFQ13790 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
APOFQ13790 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
APOFQ13790 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
APOFQ13790 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
APOFQ13790 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
APOFQ13790 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
APOFQ13790 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
APOFQ13790 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
APOFQ13790 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
APOFQ13790 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
APOFQ13790 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
APOFQ13790 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
APOFQ13790 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
APOFQ13790 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
APOFQ13790 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
APOFQ13790 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
APOFQ13790 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
APOFQ13790 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
APOFQ13790 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
APOFQ13790 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
APOFQ13790 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
APOFQ13790 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
APOFQ13790 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
APOFQ13790 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
APOFQ13790 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
APOFQ13790 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
APOFQ13790 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
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