Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CUL1Q13616 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CUL1Q13616 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CUL1Q13616 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CUL1Q13616 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CUL1Q13616 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CUL1Q13616 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CUL1Q13616 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CUL1Q13616 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CUL1Q13616 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CUL1Q13616 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CUL1Q13616 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CUL1Q13616 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CUL1Q13616 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CUL1Q13616 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CUL1Q13616 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CUL1Q13616 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CUL1Q13616 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CUL1Q13616 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
CUL1Q13616 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
CUL1Q13616 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
CUL1Q13616 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
CUL1Q13616 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
CUL1Q13616 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CUL1Q13616 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CUL1Q13616 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CUL1Q13616 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CUL1Q13616 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CUL1Q13616 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CUL1Q13616 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CUL1Q13616 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CUL1Q13616 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CUL1Q13616 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CUL1Q13616 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CUL1Q13616 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CUL1Q13616 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CUL1Q13616 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CUL1Q13616 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CUL1Q13616 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CUL1Q13616 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CUL1Q13616 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CUL1Q13616 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CUL1Q13616 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CUL1Q13616 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CUL1Q13616 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CUL1Q13616 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CUL1Q13616 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CUL1Q13616 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CUL1Q13616 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CUL1Q13616 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CUL1Q13616 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CUL1Q13616 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CUL1Q13616 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CUL1Q13616 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CUL1Q13616 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CUL1Q13616 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CUL1Q13616 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CUL1Q13616 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CUL1Q13616 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CUL1Q13616 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CUL1Q13616 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CUL1Q13616 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CUL1Q13616 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CUL1Q13616 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CUL1Q13616 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CUL1Q13616 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CUL1Q13616 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CUL1Q13616 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CUL1Q13616 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CUL1Q13616 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CUL1Q13616 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CUL1Q13616 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CUL1Q13616 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CUL1Q13616 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CUL1Q13616 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CUL1Q13616 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CUL1Q13616 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CUL1Q13616 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CUL1Q13616 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CUL1Q13616 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CUL1Q13616 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CUL1Q13616 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CUL1Q13616 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CUL1Q13616 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CUL1Q13616 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CUL1Q13616 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CUL1Q13616 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CUL1Q13616 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CUL1Q13616 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CUL1Q13616 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CUL1Q13616 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CUL1Q13616 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CUL1Q13616 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CUL1Q13616 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CUL1Q13616 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CUL1Q13616 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CUL1Q13616 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CUL1Q13616 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CUL1Q13616 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CUL1Q13616 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
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