Protein–RNA interactions for Protein: Q13568

IRF5, Interferon regulatory factor 5, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF5Q13568 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
IRF5Q13568 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
IRF5Q13568 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
IRF5Q13568 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
IRF5Q13568 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
IRF5Q13568 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
IRF5Q13568 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
IRF5Q13568 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
IRF5Q13568 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
IRF5Q13568 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
IRF5Q13568 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
IRF5Q13568 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
IRF5Q13568 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
IRF5Q13568 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
IRF5Q13568 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
IRF5Q13568 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
IRF5Q13568 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
IRF5Q13568 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
IRF5Q13568 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
IRF5Q13568 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
IRF5Q13568 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
IRF5Q13568 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
IRF5Q13568 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
IRF5Q13568 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
IRF5Q13568 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
IRF5Q13568 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
IRF5Q13568 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
IRF5Q13568 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
IRF5Q13568 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
IRF5Q13568 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
IRF5Q13568 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
IRF5Q13568 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
IRF5Q13568 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
IRF5Q13568 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
IRF5Q13568 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
IRF5Q13568 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
IRF5Q13568 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
IRF5Q13568 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
IRF5Q13568 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC19.54■□□□□ 0.72
IRF5Q13568 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
IRF5Q13568 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
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IRF5Q13568 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
IRF5Q13568 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
IRF5Q13568 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC19.54■□□□□ 0.72
IRF5Q13568 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
IRF5Q13568 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
IRF5Q13568 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
IRF5Q13568 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
IRF5Q13568 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
IRF5Q13568 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
IRF5Q13568 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
IRF5Q13568 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
IRF5Q13568 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
IRF5Q13568 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
IRF5Q13568 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
IRF5Q13568 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
IRF5Q13568 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
IRF5Q13568 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
IRF5Q13568 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
IRF5Q13568 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
IRF5Q13568 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
IRF5Q13568 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
IRF5Q13568 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
IRF5Q13568 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
IRF5Q13568 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
IRF5Q13568 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
IRF5Q13568 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
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IRF5Q13568 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
IRF5Q13568 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
IRF5Q13568 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
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IRF5Q13568 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
IRF5Q13568 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
IRF5Q13568 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
IRF5Q13568 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
IRF5Q13568 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
IRF5Q13568 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
IRF5Q13568 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
IRF5Q13568 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
IRF5Q13568 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
IRF5Q13568 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
IRF5Q13568 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
IRF5Q13568 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
IRF5Q13568 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
IRF5Q13568 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
IRF5Q13568 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
IRF5Q13568 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
IRF5Q13568 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
IRF5Q13568 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
IRF5Q13568 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
IRF5Q13568 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
IRF5Q13568 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
IRF5Q13568 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
IRF5Q13568 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
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