Protein–RNA interactions for Protein: Q13156

RPA4, Replication protein A 30 kDa subunit, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA4Q13156 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RPA4Q13156 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RPA4Q13156 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RPA4Q13156 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RPA4Q13156 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RPA4Q13156 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RPA4Q13156 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RPA4Q13156 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RPA4Q13156 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RPA4Q13156 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RPA4Q13156 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RPA4Q13156 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RPA4Q13156 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RPA4Q13156 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RPA4Q13156 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RPA4Q13156 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RPA4Q13156 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RPA4Q13156 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RPA4Q13156 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RPA4Q13156 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RPA4Q13156 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RPA4Q13156 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RPA4Q13156 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RPA4Q13156 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RPA4Q13156 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RPA4Q13156 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RPA4Q13156 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RPA4Q13156 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RPA4Q13156 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RPA4Q13156 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RPA4Q13156 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RPA4Q13156 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RPA4Q13156 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RPA4Q13156 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RPA4Q13156 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RPA4Q13156 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RPA4Q13156 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RPA4Q13156 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RPA4Q13156 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RPA4Q13156 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RPA4Q13156 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RPA4Q13156 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RPA4Q13156 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RPA4Q13156 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RPA4Q13156 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RPA4Q13156 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RPA4Q13156 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RPA4Q13156 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RPA4Q13156 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RPA4Q13156 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RPA4Q13156 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
RPA4Q13156 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RPA4Q13156 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RPA4Q13156 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RPA4Q13156 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RPA4Q13156 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RPA4Q13156 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RPA4Q13156 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RPA4Q13156 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RPA4Q13156 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RPA4Q13156 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RPA4Q13156 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RPA4Q13156 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RPA4Q13156 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RPA4Q13156 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RPA4Q13156 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RPA4Q13156 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RPA4Q13156 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RPA4Q13156 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
RPA4Q13156 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RPA4Q13156 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RPA4Q13156 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RPA4Q13156 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
RPA4Q13156 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RPA4Q13156 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RPA4Q13156 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
RPA4Q13156 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RPA4Q13156 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RPA4Q13156 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
RPA4Q13156 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
RPA4Q13156 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
RPA4Q13156 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RPA4Q13156 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RPA4Q13156 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RPA4Q13156 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RPA4Q13156 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RPA4Q13156 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RPA4Q13156 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RPA4Q13156 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RPA4Q13156 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RPA4Q13156 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RPA4Q13156 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RPA4Q13156 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RPA4Q13156 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RPA4Q13156 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RPA4Q13156 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
RPA4Q13156 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RPA4Q13156 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RPA4Q13156 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RPA4Q13156 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms