Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
DUSP4Q13115 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
DUSP4Q13115 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
DUSP4Q13115 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
DUSP4Q13115 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
DUSP4Q13115 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
DUSP4Q13115 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
DUSP4Q13115 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
DUSP4Q13115 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
DUSP4Q13115 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
DUSP4Q13115 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
DUSP4Q13115 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
DUSP4Q13115 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
DUSP4Q13115 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
DUSP4Q13115 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
DUSP4Q13115 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
DUSP4Q13115 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
DUSP4Q13115 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
DUSP4Q13115 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
DUSP4Q13115 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
DUSP4Q13115 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
DUSP4Q13115 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
DUSP4Q13115 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
DUSP4Q13115 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
DUSP4Q13115 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
DUSP4Q13115 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
DUSP4Q13115 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
DUSP4Q13115 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
DUSP4Q13115 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
DUSP4Q13115 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
DUSP4Q13115 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
DUSP4Q13115 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
DUSP4Q13115 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
DUSP4Q13115 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
DUSP4Q13115 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
DUSP4Q13115 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
DUSP4Q13115 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
DUSP4Q13115 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
DUSP4Q13115 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
DUSP4Q13115 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
DUSP4Q13115 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
DUSP4Q13115 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
DUSP4Q13115 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
DUSP4Q13115 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
DUSP4Q13115 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
DUSP4Q13115 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
DUSP4Q13115 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
DUSP4Q13115 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
DUSP4Q13115 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
DUSP4Q13115 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
DUSP4Q13115 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
DUSP4Q13115 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
DUSP4Q13115 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
DUSP4Q13115 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
DUSP4Q13115 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
DUSP4Q13115 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
DUSP4Q13115 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
DUSP4Q13115 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
DUSP4Q13115 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
DUSP4Q13115 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
DUSP4Q13115 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
DUSP4Q13115 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
DUSP4Q13115 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
DUSP4Q13115 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
DUSP4Q13115 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
DUSP4Q13115 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
DUSP4Q13115 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
DUSP4Q13115 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
DUSP4Q13115 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
DUSP4Q13115 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
DUSP4Q13115 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
DUSP4Q13115 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
DUSP4Q13115 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
DUSP4Q13115 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
DUSP4Q13115 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
DUSP4Q13115 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
DUSP4Q13115 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
DUSP4Q13115 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
DUSP4Q13115 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
DUSP4Q13115 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
DUSP4Q13115 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
DUSP4Q13115 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
DUSP4Q13115 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
DUSP4Q13115 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
DUSP4Q13115 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
DUSP4Q13115 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
DUSP4Q13115 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
DUSP4Q13115 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
DUSP4Q13115 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
DUSP4Q13115 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
DUSP4Q13115 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
DUSP4Q13115 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
DUSP4Q13115 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
DUSP4Q13115 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
DUSP4Q13115 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
DUSP4Q13115 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
DUSP4Q13115 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
DUSP4Q13115 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
DUSP4Q13115 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
DUSP4Q13115 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
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