Protein–RNA interactions for Protein: Q12933

TRAF2, TNF receptor-associated factor 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF2Q12933 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRAF2Q12933 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRAF2Q12933 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRAF2Q12933 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRAF2Q12933 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRAF2Q12933 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRAF2Q12933 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRAF2Q12933 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRAF2Q12933 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRAF2Q12933 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRAF2Q12933 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRAF2Q12933 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRAF2Q12933 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRAF2Q12933 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRAF2Q12933 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRAF2Q12933 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRAF2Q12933 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRAF2Q12933 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRAF2Q12933 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRAF2Q12933 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRAF2Q12933 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRAF2Q12933 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRAF2Q12933 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRAF2Q12933 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRAF2Q12933 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRAF2Q12933 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRAF2Q12933 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRAF2Q12933 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRAF2Q12933 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRAF2Q12933 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRAF2Q12933 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
TRAF2Q12933 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRAF2Q12933 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRAF2Q12933 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRAF2Q12933 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRAF2Q12933 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
TRAF2Q12933 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRAF2Q12933 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRAF2Q12933 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRAF2Q12933 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRAF2Q12933 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRAF2Q12933 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRAF2Q12933 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
TRAF2Q12933 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRAF2Q12933 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
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TRAF2Q12933 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
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TRAF2Q12933 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRAF2Q12933 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRAF2Q12933 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
TRAF2Q12933 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRAF2Q12933 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRAF2Q12933 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRAF2Q12933 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRAF2Q12933 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
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TRAF2Q12933 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRAF2Q12933 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRAF2Q12933 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRAF2Q12933 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRAF2Q12933 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRAF2Q12933 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
TRAF2Q12933 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRAF2Q12933 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRAF2Q12933 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRAF2Q12933 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRAF2Q12933 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRAF2Q12933 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRAF2Q12933 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRAF2Q12933 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRAF2Q12933 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRAF2Q12933 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRAF2Q12933 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
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TRAF2Q12933 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRAF2Q12933 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRAF2Q12933 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
TRAF2Q12933 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRAF2Q12933 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRAF2Q12933 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRAF2Q12933 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
TRAF2Q12933 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
TRAF2Q12933 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
TRAF2Q12933 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.43
TRAF2Q12933 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TRAF2Q12933 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TRAF2Q12933 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
TRAF2Q12933 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TRAF2Q12933 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRAF2Q12933 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRAF2Q12933 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRAF2Q12933 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRAF2Q12933 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRAF2Q12933 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
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