Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF96

CGNL1, Cingulin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGNL1Q0VF96 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CGNL1Q0VF96 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CGNL1Q0VF96 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CGNL1Q0VF96 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CGNL1Q0VF96 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CGNL1Q0VF96 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CGNL1Q0VF96 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CGNL1Q0VF96 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CGNL1Q0VF96 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CGNL1Q0VF96 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CGNL1Q0VF96 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CGNL1Q0VF96 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CGNL1Q0VF96 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CGNL1Q0VF96 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CGNL1Q0VF96 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CGNL1Q0VF96 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CGNL1Q0VF96 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CGNL1Q0VF96 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CGNL1Q0VF96 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CGNL1Q0VF96 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CGNL1Q0VF96 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CGNL1Q0VF96 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CGNL1Q0VF96 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CGNL1Q0VF96 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CGNL1Q0VF96 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
CGNL1Q0VF96 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CGNL1Q0VF96 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CGNL1Q0VF96 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CGNL1Q0VF96 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CGNL1Q0VF96 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CGNL1Q0VF96 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CGNL1Q0VF96 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CGNL1Q0VF96 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CGNL1Q0VF96 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CGNL1Q0VF96 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CGNL1Q0VF96 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CGNL1Q0VF96 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CGNL1Q0VF96 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CGNL1Q0VF96 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CGNL1Q0VF96 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CGNL1Q0VF96 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CGNL1Q0VF96 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CGNL1Q0VF96 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CGNL1Q0VF96 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CGNL1Q0VF96 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CGNL1Q0VF96 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CGNL1Q0VF96 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CGNL1Q0VF96 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CGNL1Q0VF96 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CGNL1Q0VF96 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CGNL1Q0VF96 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CGNL1Q0VF96 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CGNL1Q0VF96 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CGNL1Q0VF96 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CGNL1Q0VF96 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CGNL1Q0VF96 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CGNL1Q0VF96 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CGNL1Q0VF96 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CGNL1Q0VF96 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CGNL1Q0VF96 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CGNL1Q0VF96 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CGNL1Q0VF96 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CGNL1Q0VF96 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CGNL1Q0VF96 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CGNL1Q0VF96 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CGNL1Q0VF96 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CGNL1Q0VF96 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CGNL1Q0VF96 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CGNL1Q0VF96 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CGNL1Q0VF96 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CGNL1Q0VF96 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CGNL1Q0VF96 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CGNL1Q0VF96 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CGNL1Q0VF96 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CGNL1Q0VF96 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CGNL1Q0VF96 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CGNL1Q0VF96 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CGNL1Q0VF96 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CGNL1Q0VF96 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CGNL1Q0VF96 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CGNL1Q0VF96 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CGNL1Q0VF96 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CGNL1Q0VF96 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CGNL1Q0VF96 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CGNL1Q0VF96 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CGNL1Q0VF96 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CGNL1Q0VF96 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CGNL1Q0VF96 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CGNL1Q0VF96 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CGNL1Q0VF96 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CGNL1Q0VF96 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CGNL1Q0VF96 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CGNL1Q0VF96 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CGNL1Q0VF96 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CGNL1Q0VF96 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CGNL1Q0VF96 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CGNL1Q0VF96 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CGNL1Q0VF96 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CGNL1Q0VF96 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CGNL1Q0VF96 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms