Protein–RNA interactions for Protein: Q07002

CDK18, Cyclin-dependent kinase 18, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK18Q07002 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDK18Q07002 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDK18Q07002 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDK18Q07002 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDK18Q07002 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDK18Q07002 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDK18Q07002 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDK18Q07002 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CDK18Q07002 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDK18Q07002 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CDK18Q07002 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDK18Q07002 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDK18Q07002 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDK18Q07002 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CDK18Q07002 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDK18Q07002 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDK18Q07002 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDK18Q07002 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDK18Q07002 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDK18Q07002 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDK18Q07002 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDK18Q07002 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDK18Q07002 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDK18Q07002 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDK18Q07002 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDK18Q07002 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDK18Q07002 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDK18Q07002 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDK18Q07002 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDK18Q07002 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDK18Q07002 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDK18Q07002 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDK18Q07002 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDK18Q07002 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDK18Q07002 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDK18Q07002 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDK18Q07002 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDK18Q07002 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDK18Q07002 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDK18Q07002 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDK18Q07002 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CDK18Q07002 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDK18Q07002 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CDK18Q07002 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDK18Q07002 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDK18Q07002 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CDK18Q07002 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDK18Q07002 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDK18Q07002 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDK18Q07002 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDK18Q07002 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDK18Q07002 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDK18Q07002 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDK18Q07002 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDK18Q07002 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDK18Q07002 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDK18Q07002 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDK18Q07002 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CDK18Q07002 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CDK18Q07002 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CDK18Q07002 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CDK18Q07002 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CDK18Q07002 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CDK18Q07002 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CDK18Q07002 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CDK18Q07002 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CDK18Q07002 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CDK18Q07002 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDK18Q07002 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDK18Q07002 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDK18Q07002 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDK18Q07002 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDK18Q07002 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDK18Q07002 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDK18Q07002 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDK18Q07002 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CDK18Q07002 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDK18Q07002 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDK18Q07002 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDK18Q07002 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDK18Q07002 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDK18Q07002 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDK18Q07002 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDK18Q07002 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDK18Q07002 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDK18Q07002 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDK18Q07002 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDK18Q07002 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDK18Q07002 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDK18Q07002 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CDK18Q07002 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDK18Q07002 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDK18Q07002 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDK18Q07002 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDK18Q07002 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDK18Q07002 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDK18Q07002 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDK18Q07002 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDK18Q07002 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDK18Q07002 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms