Protein–RNA interactions for Protein: Q06828

FMOD, Fibromodulin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FMODQ06828 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FMODQ06828 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FMODQ06828 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FMODQ06828 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FMODQ06828 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FMODQ06828 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FMODQ06828 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FMODQ06828 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FMODQ06828 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FMODQ06828 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FMODQ06828 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FMODQ06828 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
FMODQ06828 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FMODQ06828 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FMODQ06828 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FMODQ06828 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FMODQ06828 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FMODQ06828 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
FMODQ06828 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
FMODQ06828 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FMODQ06828 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FMODQ06828 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FMODQ06828 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FMODQ06828 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FMODQ06828 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FMODQ06828 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FMODQ06828 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FMODQ06828 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FMODQ06828 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FMODQ06828 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FMODQ06828 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FMODQ06828 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FMODQ06828 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FMODQ06828 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FMODQ06828 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FMODQ06828 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
FMODQ06828 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
FMODQ06828 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
FMODQ06828 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
FMODQ06828 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
FMODQ06828 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
FMODQ06828 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
FMODQ06828 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
FMODQ06828 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
FMODQ06828 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
FMODQ06828 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
FMODQ06828 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FMODQ06828 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FMODQ06828 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FMODQ06828 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FMODQ06828 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FMODQ06828 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FMODQ06828 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FMODQ06828 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
FMODQ06828 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
FMODQ06828 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FMODQ06828 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
FMODQ06828 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FMODQ06828 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
FMODQ06828 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
FMODQ06828 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FMODQ06828 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
FMODQ06828 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FMODQ06828 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FMODQ06828 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FMODQ06828 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FMODQ06828 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FMODQ06828 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FMODQ06828 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FMODQ06828 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FMODQ06828 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FMODQ06828 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FMODQ06828 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FMODQ06828 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FMODQ06828 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FMODQ06828 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FMODQ06828 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FMODQ06828 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FMODQ06828 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FMODQ06828 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FMODQ06828 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FMODQ06828 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FMODQ06828 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FMODQ06828 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FMODQ06828 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FMODQ06828 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FMODQ06828 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
FMODQ06828 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
FMODQ06828 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FMODQ06828 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FMODQ06828 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FMODQ06828 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FMODQ06828 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FMODQ06828 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FMODQ06828 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FMODQ06828 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
FMODQ06828 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FMODQ06828 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FMODQ06828 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FMODQ06828 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms