Protein–RNA interactions for Protein: Q06547

GABPB1, GA-binding protein subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPB1Q06547 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GABPB1Q06547 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GABPB1Q06547 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GABPB1Q06547 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GABPB1Q06547 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GABPB1Q06547 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GABPB1Q06547 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GABPB1Q06547 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GABPB1Q06547 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GABPB1Q06547 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
GABPB1Q06547 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GABPB1Q06547 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GABPB1Q06547 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GABPB1Q06547 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GABPB1Q06547 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GABPB1Q06547 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GABPB1Q06547 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GABPB1Q06547 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GABPB1Q06547 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GABPB1Q06547 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GABPB1Q06547 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GABPB1Q06547 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GABPB1Q06547 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GABPB1Q06547 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GABPB1Q06547 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GABPB1Q06547 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GABPB1Q06547 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GABPB1Q06547 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GABPB1Q06547 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GABPB1Q06547 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
GABPB1Q06547 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GABPB1Q06547 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GABPB1Q06547 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GABPB1Q06547 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GABPB1Q06547 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GABPB1Q06547 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GABPB1Q06547 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GABPB1Q06547 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GABPB1Q06547 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GABPB1Q06547 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GABPB1Q06547 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GABPB1Q06547 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GABPB1Q06547 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GABPB1Q06547 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GABPB1Q06547 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GABPB1Q06547 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GABPB1Q06547 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GABPB1Q06547 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GABPB1Q06547 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GABPB1Q06547 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GABPB1Q06547 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GABPB1Q06547 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GABPB1Q06547 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GABPB1Q06547 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GABPB1Q06547 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GABPB1Q06547 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GABPB1Q06547 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GABPB1Q06547 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GABPB1Q06547 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GABPB1Q06547 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GABPB1Q06547 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GABPB1Q06547 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GABPB1Q06547 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GABPB1Q06547 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GABPB1Q06547 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GABPB1Q06547 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GABPB1Q06547 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GABPB1Q06547 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GABPB1Q06547 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GABPB1Q06547 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GABPB1Q06547 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GABPB1Q06547 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GABPB1Q06547 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GABPB1Q06547 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GABPB1Q06547 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GABPB1Q06547 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GABPB1Q06547 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GABPB1Q06547 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GABPB1Q06547 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GABPB1Q06547 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GABPB1Q06547 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GABPB1Q06547 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GABPB1Q06547 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GABPB1Q06547 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
GABPB1Q06547 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GABPB1Q06547 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GABPB1Q06547 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GABPB1Q06547 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GABPB1Q06547 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GABPB1Q06547 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GABPB1Q06547 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GABPB1Q06547 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GABPB1Q06547 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GABPB1Q06547 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GABPB1Q06547 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GABPB1Q06547 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GABPB1Q06547 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GABPB1Q06547 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
GABPB1Q06547 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GABPB1Q06547 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms