Protein–RNA interactions for Protein: P78412

IRX6, Iroquois-class homeodomain protein IRX-6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX6P78412 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
IRX6P78412 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
IRX6P78412 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
IRX6P78412 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
IRX6P78412 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
IRX6P78412 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
IRX6P78412 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
IRX6P78412 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
IRX6P78412 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
IRX6P78412 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
IRX6P78412 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
IRX6P78412 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
IRX6P78412 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
IRX6P78412 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
IRX6P78412 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
IRX6P78412 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
IRX6P78412 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
IRX6P78412 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
IRX6P78412 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
IRX6P78412 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
IRX6P78412 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
IRX6P78412 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
IRX6P78412 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
IRX6P78412 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
IRX6P78412 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
IRX6P78412 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
IRX6P78412 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
IRX6P78412 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
IRX6P78412 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
IRX6P78412 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
IRX6P78412 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
IRX6P78412 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
IRX6P78412 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
IRX6P78412 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
IRX6P78412 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
IRX6P78412 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
IRX6P78412 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
IRX6P78412 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
IRX6P78412 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
IRX6P78412 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
IRX6P78412 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
IRX6P78412 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
IRX6P78412 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
IRX6P78412 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
IRX6P78412 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
IRX6P78412 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
IRX6P78412 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
IRX6P78412 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
IRX6P78412 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
IRX6P78412 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
IRX6P78412 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
IRX6P78412 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
IRX6P78412 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
IRX6P78412 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
IRX6P78412 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
IRX6P78412 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
IRX6P78412 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
IRX6P78412 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
IRX6P78412 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
IRX6P78412 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
IRX6P78412 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
IRX6P78412 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
IRX6P78412 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
IRX6P78412 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
IRX6P78412 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
IRX6P78412 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
IRX6P78412 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
IRX6P78412 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
IRX6P78412 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
IRX6P78412 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
IRX6P78412 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
IRX6P78412 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
IRX6P78412 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
IRX6P78412 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
IRX6P78412 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
IRX6P78412 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
IRX6P78412 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
IRX6P78412 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
IRX6P78412 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
IRX6P78412 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
IRX6P78412 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
IRX6P78412 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
IRX6P78412 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
IRX6P78412 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
IRX6P78412 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
IRX6P78412 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
IRX6P78412 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
IRX6P78412 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
IRX6P78412 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
IRX6P78412 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
IRX6P78412 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
IRX6P78412 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
IRX6P78412 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
IRX6P78412 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
IRX6P78412 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
IRX6P78412 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
IRX6P78412 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
IRX6P78412 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
IRX6P78412 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
IRX6P78412 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms