Protein–RNA interactions for Protein: P61550

ERVS71-1, Endogenous retrovirus group S71 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVS71-1P61550 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVS71-1P61550 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVS71-1P61550 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVS71-1P61550 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVS71-1P61550 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVS71-1P61550 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVS71-1P61550 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVS71-1P61550 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVS71-1P61550 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVS71-1P61550 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVS71-1P61550 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVS71-1P61550 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVS71-1P61550 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVS71-1P61550 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVS71-1P61550 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVS71-1P61550 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVS71-1P61550 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVS71-1P61550 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVS71-1P61550 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVS71-1P61550 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVS71-1P61550 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVS71-1P61550 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVS71-1P61550 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVS71-1P61550 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVS71-1P61550 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVS71-1P61550 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVS71-1P61550 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVS71-1P61550 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVS71-1P61550 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVS71-1P61550 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVS71-1P61550 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVS71-1P61550 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVS71-1P61550 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVS71-1P61550 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVS71-1P61550 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVS71-1P61550 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVS71-1P61550 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVS71-1P61550 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVS71-1P61550 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVS71-1P61550 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVS71-1P61550 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVS71-1P61550 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVS71-1P61550 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVS71-1P61550 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVS71-1P61550 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVS71-1P61550 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVS71-1P61550 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVS71-1P61550 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVS71-1P61550 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVS71-1P61550 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVS71-1P61550 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVS71-1P61550 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVS71-1P61550 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVS71-1P61550 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVS71-1P61550 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVS71-1P61550 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVS71-1P61550 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVS71-1P61550 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVS71-1P61550 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVS71-1P61550 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVS71-1P61550 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVS71-1P61550 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVS71-1P61550 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVS71-1P61550 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVS71-1P61550 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVS71-1P61550 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVS71-1P61550 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVS71-1P61550 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVS71-1P61550 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVS71-1P61550 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVS71-1P61550 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVS71-1P61550 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVS71-1P61550 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVS71-1P61550 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVS71-1P61550 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVS71-1P61550 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVS71-1P61550 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVS71-1P61550 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVS71-1P61550 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVS71-1P61550 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVS71-1P61550 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVS71-1P61550 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVS71-1P61550 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERVS71-1P61550 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERVS71-1P61550 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ERVS71-1P61550 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERVS71-1P61550 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERVS71-1P61550 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERVS71-1P61550 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERVS71-1P61550 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERVS71-1P61550 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERVS71-1P61550 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERVS71-1P61550 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERVS71-1P61550 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERVS71-1P61550 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERVS71-1P61550 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ERVS71-1P61550 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERVS71-1P61550 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERVS71-1P61550 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERVS71-1P61550 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms