Protein–RNA interactions for Protein: P57775

FBXW4, F-box/WD repeat-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXW4P57775 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FBXW4P57775 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FBXW4P57775 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FBXW4P57775 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FBXW4P57775 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FBXW4P57775 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FBXW4P57775 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FBXW4P57775 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FBXW4P57775 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FBXW4P57775 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FBXW4P57775 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FBXW4P57775 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FBXW4P57775 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FBXW4P57775 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FBXW4P57775 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FBXW4P57775 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FBXW4P57775 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FBXW4P57775 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FBXW4P57775 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FBXW4P57775 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FBXW4P57775 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FBXW4P57775 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FBXW4P57775 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FBXW4P57775 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FBXW4P57775 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
FBXW4P57775 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FBXW4P57775 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FBXW4P57775 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FBXW4P57775 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FBXW4P57775 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FBXW4P57775 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
FBXW4P57775 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FBXW4P57775 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FBXW4P57775 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FBXW4P57775 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FBXW4P57775 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FBXW4P57775 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
FBXW4P57775 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FBXW4P57775 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FBXW4P57775 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FBXW4P57775 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FBXW4P57775 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FBXW4P57775 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FBXW4P57775 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FBXW4P57775 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FBXW4P57775 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FBXW4P57775 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FBXW4P57775 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FBXW4P57775 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FBXW4P57775 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FBXW4P57775 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
FBXW4P57775 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FBXW4P57775 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FBXW4P57775 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FBXW4P57775 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FBXW4P57775 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FBXW4P57775 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FBXW4P57775 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FBXW4P57775 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FBXW4P57775 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FBXW4P57775 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FBXW4P57775 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FBXW4P57775 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FBXW4P57775 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
FBXW4P57775 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FBXW4P57775 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
FBXW4P57775 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
FBXW4P57775 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FBXW4P57775 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
FBXW4P57775 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
FBXW4P57775 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FBXW4P57775 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
FBXW4P57775 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FBXW4P57775 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
FBXW4P57775 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
FBXW4P57775 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FBXW4P57775 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FBXW4P57775 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FBXW4P57775 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FBXW4P57775 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FBXW4P57775 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FBXW4P57775 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FBXW4P57775 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FBXW4P57775 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FBXW4P57775 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FBXW4P57775 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FBXW4P57775 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FBXW4P57775 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
FBXW4P57775 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FBXW4P57775 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FBXW4P57775 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FBXW4P57775 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FBXW4P57775 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FBXW4P57775 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
FBXW4P57775 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FBXW4P57775 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FBXW4P57775 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FBXW4P57775 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FBXW4P57775 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FBXW4P57775 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms