Protein–RNA interactions for Protein: P56180

TPTE, Putative tyrosine-protein phosphatase TPTE, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPTEP56180 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TPTEP56180 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TPTEP56180 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TPTEP56180 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TPTEP56180 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TPTEP56180 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TPTEP56180 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TPTEP56180 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TPTEP56180 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TPTEP56180 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TPTEP56180 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TPTEP56180 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TPTEP56180 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TPTEP56180 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TPTEP56180 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TPTEP56180 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TPTEP56180 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TPTEP56180 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TPTEP56180 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TPTEP56180 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TPTEP56180 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TPTEP56180 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TPTEP56180 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TPTEP56180 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TPTEP56180 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TPTEP56180 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TPTEP56180 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TPTEP56180 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TPTEP56180 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TPTEP56180 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TPTEP56180 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TPTEP56180 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TPTEP56180 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TPTEP56180 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TPTEP56180 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TPTEP56180 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TPTEP56180 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TPTEP56180 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TPTEP56180 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TPTEP56180 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TPTEP56180 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TPTEP56180 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TPTEP56180 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TPTEP56180 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TPTEP56180 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TPTEP56180 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TPTEP56180 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TPTEP56180 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TPTEP56180 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TPTEP56180 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TPTEP56180 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TPTEP56180 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TPTEP56180 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TPTEP56180 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TPTEP56180 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TPTEP56180 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TPTEP56180 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TPTEP56180 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TPTEP56180 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TPTEP56180 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TPTEP56180 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TPTEP56180 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TPTEP56180 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TPTEP56180 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TPTEP56180 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TPTEP56180 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TPTEP56180 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TPTEP56180 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TPTEP56180 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TPTEP56180 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TPTEP56180 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TPTEP56180 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TPTEP56180 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TPTEP56180 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TPTEP56180 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TPTEP56180 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TPTEP56180 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TPTEP56180 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TPTEP56180 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TPTEP56180 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TPTEP56180 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TPTEP56180 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TPTEP56180 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TPTEP56180 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TPTEP56180 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TPTEP56180 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TPTEP56180 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TPTEP56180 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TPTEP56180 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TPTEP56180 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TPTEP56180 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TPTEP56180 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TPTEP56180 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TPTEP56180 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TPTEP56180 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TPTEP56180 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TPTEP56180 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TPTEP56180 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TPTEP56180 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TPTEP56180 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms