Protein–RNA interactions for Protein: P52798

EFNA4, Ephrin-A4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA4P52798 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
EFNA4P52798 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
EFNA4P52798 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
EFNA4P52798 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
EFNA4P52798 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
EFNA4P52798 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
EFNA4P52798 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
EFNA4P52798 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
EFNA4P52798 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
EFNA4P52798 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
EFNA4P52798 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
EFNA4P52798 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
EFNA4P52798 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
EFNA4P52798 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
EFNA4P52798 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
EFNA4P52798 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
EFNA4P52798 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
EFNA4P52798 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
EFNA4P52798 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
EFNA4P52798 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
EFNA4P52798 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
EFNA4P52798 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
EFNA4P52798 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
EFNA4P52798 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
EFNA4P52798 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
EFNA4P52798 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
EFNA4P52798 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
EFNA4P52798 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
EFNA4P52798 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
EFNA4P52798 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
EFNA4P52798 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
EFNA4P52798 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
EFNA4P52798 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
EFNA4P52798 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
EFNA4P52798 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
EFNA4P52798 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
EFNA4P52798 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.07
EFNA4P52798 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
EFNA4P52798 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
EFNA4P52798 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
EFNA4P52798 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
EFNA4P52798 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
EFNA4P52798 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
EFNA4P52798 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
EFNA4P52798 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
EFNA4P52798 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
EFNA4P52798 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
EFNA4P52798 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
EFNA4P52798 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
EFNA4P52798 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
EFNA4P52798 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
EFNA4P52798 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
EFNA4P52798 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
EFNA4P52798 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
EFNA4P52798 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
EFNA4P52798 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
EFNA4P52798 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
EFNA4P52798 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
EFNA4P52798 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
EFNA4P52798 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
EFNA4P52798 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
EFNA4P52798 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
EFNA4P52798 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
EFNA4P52798 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
EFNA4P52798 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
EFNA4P52798 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
EFNA4P52798 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
EFNA4P52798 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
EFNA4P52798 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
EFNA4P52798 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
EFNA4P52798 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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EFNA4P52798 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
EFNA4P52798 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
EFNA4P52798 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
EFNA4P52798 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
EFNA4P52798 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
EFNA4P52798 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
EFNA4P52798 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
EFNA4P52798 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
EFNA4P52798 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
EFNA4P52798 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
EFNA4P52798 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
EFNA4P52798 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
EFNA4P52798 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
EFNA4P52798 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
EFNA4P52798 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
EFNA4P52798 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
EFNA4P52798 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
EFNA4P52798 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
EFNA4P52798 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
EFNA4P52798 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
EFNA4P52798 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
EFNA4P52798 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
EFNA4P52798 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
EFNA4P52798 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
EFNA4P52798 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
EFNA4P52798 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
EFNA4P52798 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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