Protein–RNA interactions for Protein: P49841

GSK3B, Glycogen synthase kinase-3 beta, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSK3BP49841 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GSK3BP49841 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GSK3BP49841 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GSK3BP49841 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GSK3BP49841 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GSK3BP49841 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GSK3BP49841 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GSK3BP49841 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GSK3BP49841 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GSK3BP49841 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GSK3BP49841 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GSK3BP49841 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GSK3BP49841 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GSK3BP49841 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GSK3BP49841 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GSK3BP49841 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GSK3BP49841 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GSK3BP49841 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GSK3BP49841 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GSK3BP49841 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GSK3BP49841 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GSK3BP49841 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GSK3BP49841 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GSK3BP49841 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GSK3BP49841 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GSK3BP49841 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GSK3BP49841 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GSK3BP49841 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GSK3BP49841 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GSK3BP49841 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
GSK3BP49841 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
GSK3BP49841 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
GSK3BP49841 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GSK3BP49841 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GSK3BP49841 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GSK3BP49841 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GSK3BP49841 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GSK3BP49841 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GSK3BP49841 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GSK3BP49841 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GSK3BP49841 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GSK3BP49841 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GSK3BP49841 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GSK3BP49841 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GSK3BP49841 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GSK3BP49841 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GSK3BP49841 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GSK3BP49841 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GSK3BP49841 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GSK3BP49841 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GSK3BP49841 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GSK3BP49841 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GSK3BP49841 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GSK3BP49841 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
GSK3BP49841 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GSK3BP49841 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GSK3BP49841 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GSK3BP49841 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GSK3BP49841 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GSK3BP49841 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GSK3BP49841 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GSK3BP49841 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GSK3BP49841 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
GSK3BP49841 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GSK3BP49841 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
GSK3BP49841 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GSK3BP49841 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
GSK3BP49841 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GSK3BP49841 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GSK3BP49841 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GSK3BP49841 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
GSK3BP49841 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GSK3BP49841 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GSK3BP49841 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GSK3BP49841 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GSK3BP49841 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GSK3BP49841 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GSK3BP49841 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GSK3BP49841 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GSK3BP49841 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
GSK3BP49841 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GSK3BP49841 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GSK3BP49841 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GSK3BP49841 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GSK3BP49841 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GSK3BP49841 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GSK3BP49841 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GSK3BP49841 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GSK3BP49841 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GSK3BP49841 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GSK3BP49841 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GSK3BP49841 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GSK3BP49841 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GSK3BP49841 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GSK3BP49841 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GSK3BP49841 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GSK3BP49841 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GSK3BP49841 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GSK3BP49841 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GSK3BP49841 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms