Protein–RNA interactions for Protein: P49639

HOXA1, Homeobox protein Hox-A1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 335 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA1P49639 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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HOXA1P49639 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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HOXA1P49639 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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HOXA1P49639 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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HOXA1P49639 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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HOXA1P49639 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXA1P49639 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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HOXA1P49639 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
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HOXA1P49639 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HOXA1P49639 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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HOXA1P49639 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HOXA1P49639 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HOXA1P49639 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HOXA1P49639 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HOXA1P49639 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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