Protein–RNA interactions for Protein: P35247

SFTPD, Pulmonary surfactant-associated protein D, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPDP35247 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SFTPDP35247 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SFTPDP35247 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SFTPDP35247 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SFTPDP35247 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SFTPDP35247 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SFTPDP35247 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SFTPDP35247 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SFTPDP35247 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SFTPDP35247 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SFTPDP35247 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SFTPDP35247 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SFTPDP35247 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SFTPDP35247 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SFTPDP35247 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SFTPDP35247 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SFTPDP35247 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SFTPDP35247 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SFTPDP35247 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SFTPDP35247 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SFTPDP35247 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SFTPDP35247 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SFTPDP35247 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SFTPDP35247 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SFTPDP35247 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SFTPDP35247 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SFTPDP35247 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SFTPDP35247 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SFTPDP35247 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SFTPDP35247 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SFTPDP35247 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SFTPDP35247 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SFTPDP35247 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SFTPDP35247 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SFTPDP35247 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SFTPDP35247 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SFTPDP35247 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SFTPDP35247 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SFTPDP35247 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SFTPDP35247 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SFTPDP35247 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SFTPDP35247 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SFTPDP35247 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SFTPDP35247 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SFTPDP35247 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SFTPDP35247 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SFTPDP35247 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SFTPDP35247 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SFTPDP35247 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SFTPDP35247 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SFTPDP35247 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SFTPDP35247 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SFTPDP35247 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SFTPDP35247 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SFTPDP35247 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SFTPDP35247 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SFTPDP35247 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SFTPDP35247 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SFTPDP35247 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SFTPDP35247 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SFTPDP35247 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SFTPDP35247 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SFTPDP35247 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SFTPDP35247 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFTPDP35247 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFTPDP35247 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFTPDP35247 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFTPDP35247 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFTPDP35247 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFTPDP35247 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFTPDP35247 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFTPDP35247 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFTPDP35247 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFTPDP35247 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFTPDP35247 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFTPDP35247 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFTPDP35247 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFTPDP35247 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFTPDP35247 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFTPDP35247 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFTPDP35247 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFTPDP35247 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SFTPDP35247 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SFTPDP35247 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFTPDP35247 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SFTPDP35247 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFTPDP35247 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFTPDP35247 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFTPDP35247 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFTPDP35247 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFTPDP35247 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFTPDP35247 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFTPDP35247 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFTPDP35247 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFTPDP35247 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFTPDP35247 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFTPDP35247 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFTPDP35247 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFTPDP35247 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFTPDP35247 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.4 ms