Protein–RNA interactions for Protein: P35221

CTNNA1, Catenin alpha-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA1P35221 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTNNA1P35221 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CTNNA1P35221 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTNNA1P35221 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CTNNA1P35221 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CTNNA1P35221 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTNNA1P35221 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTNNA1P35221 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTNNA1P35221 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTNNA1P35221 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTNNA1P35221 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTNNA1P35221 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTNNA1P35221 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTNNA1P35221 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTNNA1P35221 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTNNA1P35221 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTNNA1P35221 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTNNA1P35221 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTNNA1P35221 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTNNA1P35221 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTNNA1P35221 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTNNA1P35221 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CTNNA1P35221 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CTNNA1P35221 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CTNNA1P35221 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CTNNA1P35221 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CTNNA1P35221 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CTNNA1P35221 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CTNNA1P35221 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CTNNA1P35221 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CTNNA1P35221 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CTNNA1P35221 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CTNNA1P35221 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CTNNA1P35221 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CTNNA1P35221 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CTNNA1P35221 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CTNNA1P35221 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CTNNA1P35221 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CTNNA1P35221 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CTNNA1P35221 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CTNNA1P35221 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CTNNA1P35221 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CTNNA1P35221 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CTNNA1P35221 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CTNNA1P35221 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTNNA1P35221 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTNNA1P35221 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTNNA1P35221 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTNNA1P35221 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTNNA1P35221 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTNNA1P35221 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTNNA1P35221 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTNNA1P35221 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTNNA1P35221 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTNNA1P35221 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CTNNA1P35221 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTNNA1P35221 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CTNNA1P35221 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTNNA1P35221 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTNNA1P35221 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTNNA1P35221 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTNNA1P35221 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTNNA1P35221 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTNNA1P35221 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTNNA1P35221 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTNNA1P35221 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTNNA1P35221 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTNNA1P35221 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTNNA1P35221 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CTNNA1P35221 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTNNA1P35221 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CTNNA1P35221 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTNNA1P35221 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTNNA1P35221 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTNNA1P35221 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CTNNA1P35221 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CTNNA1P35221 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTNNA1P35221 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTNNA1P35221 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTNNA1P35221 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTNNA1P35221 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTNNA1P35221 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTNNA1P35221 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CTNNA1P35221 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTNNA1P35221 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTNNA1P35221 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTNNA1P35221 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTNNA1P35221 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTNNA1P35221 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTNNA1P35221 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTNNA1P35221 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTNNA1P35221 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTNNA1P35221 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTNNA1P35221 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTNNA1P35221 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTNNA1P35221 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTNNA1P35221 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTNNA1P35221 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTNNA1P35221 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTNNA1P35221 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms