Protein–RNA interactions for Protein: P35125

USP6, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP6P35125 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP6P35125 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP6P35125 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP6P35125 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP6P35125 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP6P35125 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP6P35125 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP6P35125 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP6P35125 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP6P35125 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP6P35125 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP6P35125 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP6P35125 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP6P35125 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
USP6P35125 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP6P35125 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP6P35125 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP6P35125 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP6P35125 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP6P35125 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP6P35125 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP6P35125 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP6P35125 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP6P35125 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP6P35125 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP6P35125 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP6P35125 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP6P35125 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP6P35125 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP6P35125 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
USP6P35125 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP6P35125 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP6P35125 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
USP6P35125 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP6P35125 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP6P35125 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP6P35125 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP6P35125 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP6P35125 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP6P35125 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP6P35125 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP6P35125 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP6P35125 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP6P35125 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP6P35125 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP6P35125 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP6P35125 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP6P35125 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP6P35125 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP6P35125 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP6P35125 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP6P35125 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
USP6P35125 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP6P35125 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP6P35125 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP6P35125 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP6P35125 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP6P35125 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP6P35125 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP6P35125 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP6P35125 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP6P35125 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP6P35125 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP6P35125 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP6P35125 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP6P35125 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP6P35125 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP6P35125 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP6P35125 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
USP6P35125 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP6P35125 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP6P35125 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP6P35125 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP6P35125 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
USP6P35125 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP6P35125 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP6P35125 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP6P35125 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP6P35125 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP6P35125 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP6P35125 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
USP6P35125 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP6P35125 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
USP6P35125 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP6P35125 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
USP6P35125 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP6P35125 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP6P35125 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
USP6P35125 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP6P35125 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP6P35125 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP6P35125 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP6P35125 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP6P35125 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP6P35125 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP6P35125 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP6P35125 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP6P35125 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP6P35125 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP6P35125 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms