Protein–RNA interactions for Protein: P28336

NMBR, Neuromedin-B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMBRP28336 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NMBRP28336 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NMBRP28336 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NMBRP28336 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NMBRP28336 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
NMBRP28336 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NMBRP28336 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NMBRP28336 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NMBRP28336 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NMBRP28336 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NMBRP28336 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
NMBRP28336 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NMBRP28336 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NMBRP28336 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NMBRP28336 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NMBRP28336 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NMBRP28336 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NMBRP28336 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NMBRP28336 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NMBRP28336 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NMBRP28336 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NMBRP28336 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NMBRP28336 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NMBRP28336 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NMBRP28336 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NMBRP28336 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NMBRP28336 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NMBRP28336 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
NMBRP28336 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
NMBRP28336 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
NMBRP28336 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
NMBRP28336 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
NMBRP28336 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
NMBRP28336 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
NMBRP28336 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
NMBRP28336 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
NMBRP28336 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
NMBRP28336 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
NMBRP28336 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
NMBRP28336 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
NMBRP28336 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NMBRP28336 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NMBRP28336 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NMBRP28336 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NMBRP28336 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NMBRP28336 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NMBRP28336 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NMBRP28336 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NMBRP28336 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NMBRP28336 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
NMBRP28336 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NMBRP28336 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NMBRP28336 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NMBRP28336 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NMBRP28336 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
NMBRP28336 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NMBRP28336 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NMBRP28336 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
NMBRP28336 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NMBRP28336 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NMBRP28336 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NMBRP28336 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NMBRP28336 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NMBRP28336 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NMBRP28336 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NMBRP28336 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NMBRP28336 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NMBRP28336 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NMBRP28336 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NMBRP28336 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NMBRP28336 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NMBRP28336 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NMBRP28336 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NMBRP28336 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NMBRP28336 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NMBRP28336 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NMBRP28336 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NMBRP28336 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NMBRP28336 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NMBRP28336 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
NMBRP28336 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NMBRP28336 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NMBRP28336 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NMBRP28336 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NMBRP28336 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NMBRP28336 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NMBRP28336 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NMBRP28336 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NMBRP28336 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NMBRP28336 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NMBRP28336 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
NMBRP28336 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
NMBRP28336 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NMBRP28336 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NMBRP28336 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NMBRP28336 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
NMBRP28336 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
NMBRP28336 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NMBRP28336 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NMBRP28336 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms