Protein–RNA interactions for Protein: P28066

PSMA5, Proteasome subunit alpha type-5, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA5P28066 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PSMA5P28066 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PSMA5P28066 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PSMA5P28066 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PSMA5P28066 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PSMA5P28066 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PSMA5P28066 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PSMA5P28066 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PSMA5P28066 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PSMA5P28066 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PSMA5P28066 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PSMA5P28066 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
PSMA5P28066 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
PSMA5P28066 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PSMA5P28066 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PSMA5P28066 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PSMA5P28066 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PSMA5P28066 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PSMA5P28066 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PSMA5P28066 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PSMA5P28066 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PSMA5P28066 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PSMA5P28066 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PSMA5P28066 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PSMA5P28066 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PSMA5P28066 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PSMA5P28066 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
PSMA5P28066 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PSMA5P28066 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PSMA5P28066 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
PSMA5P28066 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PSMA5P28066 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PSMA5P28066 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PSMA5P28066 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
PSMA5P28066 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PSMA5P28066 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PSMA5P28066 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PSMA5P28066 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PSMA5P28066 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PSMA5P28066 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PSMA5P28066 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PSMA5P28066 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PSMA5P28066 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PSMA5P28066 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PSMA5P28066 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PSMA5P28066 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PSMA5P28066 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PSMA5P28066 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
PSMA5P28066 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
PSMA5P28066 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PSMA5P28066 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PSMA5P28066 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PSMA5P28066 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PSMA5P28066 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PSMA5P28066 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
PSMA5P28066 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PSMA5P28066 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PSMA5P28066 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PSMA5P28066 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PSMA5P28066 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PSMA5P28066 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
PSMA5P28066 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PSMA5P28066 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PSMA5P28066 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PSMA5P28066 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PSMA5P28066 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PSMA5P28066 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PSMA5P28066 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PSMA5P28066 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PSMA5P28066 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PSMA5P28066 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PSMA5P28066 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PSMA5P28066 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PSMA5P28066 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PSMA5P28066 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PSMA5P28066 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PSMA5P28066 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PSMA5P28066 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PSMA5P28066 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PSMA5P28066 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PSMA5P28066 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PSMA5P28066 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PSMA5P28066 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PSMA5P28066 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PSMA5P28066 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PSMA5P28066 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PSMA5P28066 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PSMA5P28066 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PSMA5P28066 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PSMA5P28066 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PSMA5P28066 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PSMA5P28066 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PSMA5P28066 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PSMA5P28066 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PSMA5P28066 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PSMA5P28066 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PSMA5P28066 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PSMA5P28066 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PSMA5P28066 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PSMA5P28066 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms