Protein–RNA interactions for Protein: P22674

CCNO, Cyclin-O, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNOP22674 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CCNOP22674 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCNOP22674 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCNOP22674 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCNOP22674 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCNOP22674 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCNOP22674 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CCNOP22674 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCNOP22674 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCNOP22674 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCNOP22674 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCNOP22674 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCNOP22674 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCNOP22674 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCNOP22674 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCNOP22674 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCNOP22674 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCNOP22674 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCNOP22674 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCNOP22674 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCNOP22674 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCNOP22674 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCNOP22674 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCNOP22674 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCNOP22674 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCNOP22674 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCNOP22674 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCNOP22674 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCNOP22674 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCNOP22674 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCNOP22674 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CCNOP22674 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCNOP22674 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CCNOP22674 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CCNOP22674 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCNOP22674 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCNOP22674 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCNOP22674 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCNOP22674 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCNOP22674 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCNOP22674 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCNOP22674 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCNOP22674 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCNOP22674 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCNOP22674 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCNOP22674 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCNOP22674 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCNOP22674 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCNOP22674 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCNOP22674 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCNOP22674 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCNOP22674 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCNOP22674 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCNOP22674 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCNOP22674 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCNOP22674 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCNOP22674 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCNOP22674 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCNOP22674 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CCNOP22674 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCNOP22674 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CCNOP22674 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CCNOP22674 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCNOP22674 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCNOP22674 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCNOP22674 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCNOP22674 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCNOP22674 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCNOP22674 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCNOP22674 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCNOP22674 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCNOP22674 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCNOP22674 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCNOP22674 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCNOP22674 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCNOP22674 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCNOP22674 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCNOP22674 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCNOP22674 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCNOP22674 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCNOP22674 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCNOP22674 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCNOP22674 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCNOP22674 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCNOP22674 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCNOP22674 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCNOP22674 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCNOP22674 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCNOP22674 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCNOP22674 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCNOP22674 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCNOP22674 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCNOP22674 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCNOP22674 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCNOP22674 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCNOP22674 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCNOP22674 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCNOP22674 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCNOP22674 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCNOP22674 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms