Protein–RNA interactions for Protein: P16619

CCL3L1, C-C motif chemokine 3-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL3L1P16619 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CCL3L1P16619 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CCL3L1P16619 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
CCL3L1P16619 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
CCL3L1P16619 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CCL3L1P16619 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CCL3L1P16619 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CCL3L1P16619 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CCL3L1P16619 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CCL3L1P16619 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CCL3L1P16619 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CCL3L1P16619 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CCL3L1P16619 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CCL3L1P16619 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CCL3L1P16619 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CCL3L1P16619 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CCL3L1P16619 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CCL3L1P16619 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CCL3L1P16619 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CCL3L1P16619 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CCL3L1P16619 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CCL3L1P16619 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CCL3L1P16619 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CCL3L1P16619 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CCL3L1P16619 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CCL3L1P16619 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CCL3L1P16619 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CCL3L1P16619 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CCL3L1P16619 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CCL3L1P16619 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CCL3L1P16619 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CCL3L1P16619 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CCL3L1P16619 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CCL3L1P16619 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CCL3L1P16619 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CCL3L1P16619 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CCL3L1P16619 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
CCL3L1P16619 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CCL3L1P16619 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CCL3L1P16619 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
CCL3L1P16619 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CCL3L1P16619 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CCL3L1P16619 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
CCL3L1P16619 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CCL3L1P16619 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CCL3L1P16619 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CCL3L1P16619 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CCL3L1P16619 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CCL3L1P16619 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CCL3L1P16619 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CCL3L1P16619 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CCL3L1P16619 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CCL3L1P16619 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CCL3L1P16619 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CCL3L1P16619 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CCL3L1P16619 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CCL3L1P16619 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CCL3L1P16619 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CCL3L1P16619 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CCL3L1P16619 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CCL3L1P16619 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CCL3L1P16619 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CCL3L1P16619 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CCL3L1P16619 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CCL3L1P16619 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CCL3L1P16619 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CCL3L1P16619 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CCL3L1P16619 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CCL3L1P16619 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CCL3L1P16619 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CCL3L1P16619 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CCL3L1P16619 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CCL3L1P16619 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CCL3L1P16619 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CCL3L1P16619 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CCL3L1P16619 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CCL3L1P16619 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CCL3L1P16619 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CCL3L1P16619 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CCL3L1P16619 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CCL3L1P16619 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CCL3L1P16619 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CCL3L1P16619 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
CCL3L1P16619 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CCL3L1P16619 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CCL3L1P16619 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CCL3L1P16619 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CCL3L1P16619 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CCL3L1P16619 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
CCL3L1P16619 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CCL3L1P16619 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CCL3L1P16619 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CCL3L1P16619 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CCL3L1P16619 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CCL3L1P16619 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CCL3L1P16619 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CCL3L1P16619 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CCL3L1P16619 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CCL3L1P16619 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC14.46□□□□□ -0.1
CCL3L1P16619 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms