Protein–RNA interactions for Protein: P13645

KRT10, Keratin, type I cytoskeletal 10, humanhuman

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT10P13645 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KRT10P13645 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KRT10P13645 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KRT10P13645 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KRT10P13645 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
KRT10P13645 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KRT10P13645 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KRT10P13645 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KRT10P13645 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KRT10P13645 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KRT10P13645 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KRT10P13645 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KRT10P13645 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KRT10P13645 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KRT10P13645 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KRT10P13645 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KRT10P13645 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KRT10P13645 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KRT10P13645 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KRT10P13645 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KRT10P13645 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KRT10P13645 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KRT10P13645 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KRT10P13645 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
KRT10P13645 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KRT10P13645 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KRT10P13645 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KRT10P13645 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KRT10P13645 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KRT10P13645 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KRT10P13645 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KRT10P13645 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KRT10P13645 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KRT10P13645 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KRT10P13645 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KRT10P13645 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KRT10P13645 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KRT10P13645 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KRT10P13645 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KRT10P13645 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KRT10P13645 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KRT10P13645 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KRT10P13645 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KRT10P13645 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KRT10P13645 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KRT10P13645 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KRT10P13645 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KRT10P13645 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KRT10P13645 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
KRT10P13645 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KRT10P13645 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KRT10P13645 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KRT10P13645 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KRT10P13645 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KRT10P13645 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KRT10P13645 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KRT10P13645 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
KRT10P13645 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KRT10P13645 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KRT10P13645 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KRT10P13645 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KRT10P13645 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KRT10P13645 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KRT10P13645 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
KRT10P13645 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KRT10P13645 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KRT10P13645 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KRT10P13645 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KRT10P13645 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KRT10P13645 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KRT10P13645 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KRT10P13645 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KRT10P13645 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KRT10P13645 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KRT10P13645 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KRT10P13645 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KRT10P13645 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KRT10P13645 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KRT10P13645 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KRT10P13645 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KRT10P13645 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KRT10P13645 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KRT10P13645 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KRT10P13645 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KRT10P13645 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KRT10P13645 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KRT10P13645 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KRT10P13645 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KRT10P13645 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KRT10P13645 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KRT10P13645 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KRT10P13645 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KRT10P13645 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KRT10P13645 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KRT10P13645 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KRT10P13645 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KRT10P13645 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KRT10P13645 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KRT10P13645 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KRT10P13645 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms