Protein–RNA interactions for Protein: P10606

COX5B, Cytochrome c oxidase subunit 5B, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX5BP10606 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
COX5BP10606 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
COX5BP10606 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
COX5BP10606 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
COX5BP10606 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
COX5BP10606 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
COX5BP10606 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
COX5BP10606 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
COX5BP10606 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
COX5BP10606 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
COX5BP10606 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
COX5BP10606 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
COX5BP10606 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
COX5BP10606 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
COX5BP10606 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
COX5BP10606 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
COX5BP10606 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
COX5BP10606 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
COX5BP10606 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
COX5BP10606 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
COX5BP10606 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
COX5BP10606 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
COX5BP10606 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
COX5BP10606 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
COX5BP10606 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
COX5BP10606 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
COX5BP10606 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
COX5BP10606 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
COX5BP10606 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
COX5BP10606 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
COX5BP10606 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
COX5BP10606 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
COX5BP10606 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
COX5BP10606 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
COX5BP10606 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
COX5BP10606 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
COX5BP10606 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
COX5BP10606 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
COX5BP10606 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
COX5BP10606 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
COX5BP10606 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
COX5BP10606 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
COX5BP10606 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
COX5BP10606 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
COX5BP10606 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
COX5BP10606 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
COX5BP10606 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
COX5BP10606 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
COX5BP10606 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
COX5BP10606 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
COX5BP10606 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
COX5BP10606 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
COX5BP10606 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
COX5BP10606 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
COX5BP10606 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
COX5BP10606 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
COX5BP10606 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
COX5BP10606 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
COX5BP10606 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
COX5BP10606 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
COX5BP10606 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
COX5BP10606 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
COX5BP10606 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
COX5BP10606 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
COX5BP10606 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
COX5BP10606 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
COX5BP10606 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
COX5BP10606 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
COX5BP10606 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
COX5BP10606 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
COX5BP10606 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
COX5BP10606 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
COX5BP10606 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
COX5BP10606 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
COX5BP10606 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
COX5BP10606 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
COX5BP10606 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
COX5BP10606 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
COX5BP10606 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
COX5BP10606 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
COX5BP10606 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
COX5BP10606 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
COX5BP10606 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
COX5BP10606 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
COX5BP10606 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
COX5BP10606 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
COX5BP10606 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
COX5BP10606 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
COX5BP10606 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
COX5BP10606 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
COX5BP10606 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
COX5BP10606 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
COX5BP10606 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
COX5BP10606 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
COX5BP10606 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
COX5BP10606 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
COX5BP10606 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
COX5BP10606 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
COX5BP10606 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
COX5BP10606 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms