Protein–RNA interactions for Protein: P0DP24

CALM2, Calmodulin-2, humanhuman

Predictions only

Length 149 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALM2P0DP24 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CALM2P0DP24 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CALM2P0DP24 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CALM2P0DP24 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CALM2P0DP24 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CALM2P0DP24 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CALM2P0DP24 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CALM2P0DP24 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CALM2P0DP24 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CALM2P0DP24 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CALM2P0DP24 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CALM2P0DP24 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CALM2P0DP24 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CALM2P0DP24 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CALM2P0DP24 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CALM2P0DP24 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CALM2P0DP24 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CALM2P0DP24 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CALM2P0DP24 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CALM2P0DP24 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CALM2P0DP24 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CALM2P0DP24 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CALM2P0DP24 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CALM2P0DP24 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CALM2P0DP24 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CALM2P0DP24 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CALM2P0DP24 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CALM2P0DP24 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CALM2P0DP24 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CALM2P0DP24 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CALM2P0DP24 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CALM2P0DP24 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CALM2P0DP24 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CALM2P0DP24 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CALM2P0DP24 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CALM2P0DP24 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CALM2P0DP24 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CALM2P0DP24 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CALM2P0DP24 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CALM2P0DP24 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CALM2P0DP24 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CALM2P0DP24 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CALM2P0DP24 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CALM2P0DP24 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CALM2P0DP24 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CALM2P0DP24 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CALM2P0DP24 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CALM2P0DP24 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CALM2P0DP24 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CALM2P0DP24 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CALM2P0DP24 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CALM2P0DP24 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CALM2P0DP24 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CALM2P0DP24 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CALM2P0DP24 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CALM2P0DP24 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CALM2P0DP24 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CALM2P0DP24 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CALM2P0DP24 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CALM2P0DP24 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CALM2P0DP24 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CALM2P0DP24 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CALM2P0DP24 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CALM2P0DP24 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CALM2P0DP24 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CALM2P0DP24 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CALM2P0DP24 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CALM2P0DP24 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CALM2P0DP24 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CALM2P0DP24 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CALM2P0DP24 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CALM2P0DP24 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CALM2P0DP24 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CALM2P0DP24 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CALM2P0DP24 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CALM2P0DP24 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CALM2P0DP24 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CALM2P0DP24 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CALM2P0DP24 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CALM2P0DP24 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CALM2P0DP24 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CALM2P0DP24 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CALM2P0DP24 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CALM2P0DP24 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CALM2P0DP24 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CALM2P0DP24 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
CALM2P0DP24 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CALM2P0DP24 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CALM2P0DP24 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CALM2P0DP24 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CALM2P0DP24 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CALM2P0DP24 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CALM2P0DP24 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
CALM2P0DP24 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CALM2P0DP24 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
CALM2P0DP24 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CALM2P0DP24 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CALM2P0DP24 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CALM2P0DP24 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CALM2P0DP24 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms