Protein–RNA interactions for Protein: P0DMW5

SMIM10L2B, Small integral membrane protein 10-like protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM10L2BP0DMW5 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SMIM10L2BP0DMW5 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SMIM10L2BP0DMW5 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SMIM10L2BP0DMW5 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SMIM10L2BP0DMW5 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SMIM10L2BP0DMW5 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SMIM10L2BP0DMW5 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SMIM10L2BP0DMW5 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SMIM10L2BP0DMW5 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SMIM10L2BP0DMW5 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SMIM10L2BP0DMW5 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SMIM10L2BP0DMW5 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SMIM10L2BP0DMW5 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SMIM10L2BP0DMW5 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SMIM10L2BP0DMW5 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SMIM10L2BP0DMW5 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SMIM10L2BP0DMW5 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SMIM10L2BP0DMW5 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SMIM10L2BP0DMW5 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SMIM10L2BP0DMW5 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SMIM10L2BP0DMW5 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SMIM10L2BP0DMW5 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SMIM10L2BP0DMW5 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SMIM10L2BP0DMW5 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SMIM10L2BP0DMW5 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SMIM10L2BP0DMW5 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SMIM10L2BP0DMW5 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SMIM10L2BP0DMW5 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
SMIM10L2BP0DMW5 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SMIM10L2BP0DMW5 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
SMIM10L2BP0DMW5 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SMIM10L2BP0DMW5 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SMIM10L2BP0DMW5 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SMIM10L2BP0DMW5 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SMIM10L2BP0DMW5 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SMIM10L2BP0DMW5 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SMIM10L2BP0DMW5 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SMIM10L2BP0DMW5 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SMIM10L2BP0DMW5 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SMIM10L2BP0DMW5 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SMIM10L2BP0DMW5 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SMIM10L2BP0DMW5 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SMIM10L2BP0DMW5 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SMIM10L2BP0DMW5 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SMIM10L2BP0DMW5 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
SMIM10L2BP0DMW5 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
SMIM10L2BP0DMW5 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SMIM10L2BP0DMW5 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
SMIM10L2BP0DMW5 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SMIM10L2BP0DMW5 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
SMIM10L2BP0DMW5 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SMIM10L2BP0DMW5 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SMIM10L2BP0DMW5 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SMIM10L2BP0DMW5 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SMIM10L2BP0DMW5 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
SMIM10L2BP0DMW5 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
SMIM10L2BP0DMW5 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SMIM10L2BP0DMW5 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SMIM10L2BP0DMW5 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
SMIM10L2BP0DMW5 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SMIM10L2BP0DMW5 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SMIM10L2BP0DMW5 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SMIM10L2BP0DMW5 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SMIM10L2BP0DMW5 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SMIM10L2BP0DMW5 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SMIM10L2BP0DMW5 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SMIM10L2BP0DMW5 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SMIM10L2BP0DMW5 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SMIM10L2BP0DMW5 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SMIM10L2BP0DMW5 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SMIM10L2BP0DMW5 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
SMIM10L2BP0DMW5 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SMIM10L2BP0DMW5 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SMIM10L2BP0DMW5 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SMIM10L2BP0DMW5 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SMIM10L2BP0DMW5 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SMIM10L2BP0DMW5 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SMIM10L2BP0DMW5 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SMIM10L2BP0DMW5 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
SMIM10L2BP0DMW5 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SMIM10L2BP0DMW5 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SMIM10L2BP0DMW5 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SMIM10L2BP0DMW5 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SMIM10L2BP0DMW5 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SMIM10L2BP0DMW5 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SMIM10L2BP0DMW5 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SMIM10L2BP0DMW5 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SMIM10L2BP0DMW5 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SMIM10L2BP0DMW5 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SMIM10L2BP0DMW5 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SMIM10L2BP0DMW5 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
SMIM10L2BP0DMW5 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
SMIM10L2BP0DMW5 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
SMIM10L2BP0DMW5 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
SMIM10L2BP0DMW5 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
SMIM10L2BP0DMW5 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
SMIM10L2BP0DMW5 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
SMIM10L2BP0DMW5 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SMIM10L2BP0DMW5 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SMIM10L2BP0DMW5 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.8 ms