Protein–RNA interactions for Protein: P0DI81

TRAPPC2, Trafficking protein particle complex subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2P0DI81 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRAPPC2P0DI81 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRAPPC2P0DI81 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRAPPC2P0DI81 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRAPPC2P0DI81 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRAPPC2P0DI81 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRAPPC2P0DI81 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRAPPC2P0DI81 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
TRAPPC2P0DI81 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRAPPC2P0DI81 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRAPPC2P0DI81 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRAPPC2P0DI81 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRAPPC2P0DI81 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRAPPC2P0DI81 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRAPPC2P0DI81 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRAPPC2P0DI81 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRAPPC2P0DI81 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRAPPC2P0DI81 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRAPPC2P0DI81 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRAPPC2P0DI81 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRAPPC2P0DI81 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRAPPC2P0DI81 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRAPPC2P0DI81 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRAPPC2P0DI81 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRAPPC2P0DI81 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRAPPC2P0DI81 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRAPPC2P0DI81 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRAPPC2P0DI81 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRAPPC2P0DI81 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRAPPC2P0DI81 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRAPPC2P0DI81 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRAPPC2P0DI81 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRAPPC2P0DI81 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRAPPC2P0DI81 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRAPPC2P0DI81 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRAPPC2P0DI81 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRAPPC2P0DI81 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRAPPC2P0DI81 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRAPPC2P0DI81 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRAPPC2P0DI81 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRAPPC2P0DI81 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRAPPC2P0DI81 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRAPPC2P0DI81 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRAPPC2P0DI81 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRAPPC2P0DI81 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRAPPC2P0DI81 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRAPPC2P0DI81 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRAPPC2P0DI81 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRAPPC2P0DI81 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRAPPC2P0DI81 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRAPPC2P0DI81 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRAPPC2P0DI81 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRAPPC2P0DI81 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRAPPC2P0DI81 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRAPPC2P0DI81 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRAPPC2P0DI81 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRAPPC2P0DI81 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRAPPC2P0DI81 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRAPPC2P0DI81 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRAPPC2P0DI81 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRAPPC2P0DI81 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRAPPC2P0DI81 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRAPPC2P0DI81 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRAPPC2P0DI81 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRAPPC2P0DI81 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRAPPC2P0DI81 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRAPPC2P0DI81 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRAPPC2P0DI81 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRAPPC2P0DI81 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRAPPC2P0DI81 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRAPPC2P0DI81 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRAPPC2P0DI81 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
TRAPPC2P0DI81 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRAPPC2P0DI81 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRAPPC2P0DI81 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRAPPC2P0DI81 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRAPPC2P0DI81 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
TRAPPC2P0DI81 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRAPPC2P0DI81 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRAPPC2P0DI81 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRAPPC2P0DI81 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRAPPC2P0DI81 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRAPPC2P0DI81 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRAPPC2P0DI81 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRAPPC2P0DI81 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRAPPC2P0DI81 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRAPPC2P0DI81 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRAPPC2P0DI81 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRAPPC2P0DI81 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRAPPC2P0DI81 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRAPPC2P0DI81 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRAPPC2P0DI81 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRAPPC2P0DI81 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAPPC2P0DI81 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAPPC2P0DI81 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAPPC2P0DI81 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAPPC2P0DI81 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAPPC2P0DI81 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAPPC2P0DI81 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAPPC2P0DI81 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms