Protein–RNA interactions for Protein: P07199

CENPB, Major centromere autoantigen B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPBP07199 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CENPBP07199 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CENPBP07199 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CENPBP07199 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CENPBP07199 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CENPBP07199 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CENPBP07199 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CENPBP07199 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CENPBP07199 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CENPBP07199 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CENPBP07199 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CENPBP07199 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CENPBP07199 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CENPBP07199 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CENPBP07199 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CENPBP07199 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CENPBP07199 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CENPBP07199 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CENPBP07199 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CENPBP07199 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CENPBP07199 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CENPBP07199 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CENPBP07199 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CENPBP07199 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CENPBP07199 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CENPBP07199 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CENPBP07199 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CENPBP07199 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CENPBP07199 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CENPBP07199 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CENPBP07199 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CENPBP07199 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CENPBP07199 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CENPBP07199 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CENPBP07199 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CENPBP07199 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CENPBP07199 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CENPBP07199 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CENPBP07199 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CENPBP07199 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CENPBP07199 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CENPBP07199 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CENPBP07199 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CENPBP07199 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CENPBP07199 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CENPBP07199 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CENPBP07199 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CENPBP07199 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CENPBP07199 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CENPBP07199 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CENPBP07199 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CENPBP07199 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CENPBP07199 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CENPBP07199 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CENPBP07199 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CENPBP07199 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CENPBP07199 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CENPBP07199 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CENPBP07199 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CENPBP07199 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CENPBP07199 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CENPBP07199 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CENPBP07199 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CENPBP07199 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CENPBP07199 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CENPBP07199 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CENPBP07199 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CENPBP07199 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CENPBP07199 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CENPBP07199 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CENPBP07199 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CENPBP07199 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CENPBP07199 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CENPBP07199 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CENPBP07199 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CENPBP07199 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CENPBP07199 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CENPBP07199 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CENPBP07199 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CENPBP07199 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CENPBP07199 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CENPBP07199 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CENPBP07199 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CENPBP07199 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CENPBP07199 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CENPBP07199 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CENPBP07199 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CENPBP07199 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CENPBP07199 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CENPBP07199 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CENPBP07199 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CENPBP07199 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CENPBP07199 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CENPBP07199 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CENPBP07199 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CENPBP07199 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CENPBP07199 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CENPBP07199 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CENPBP07199 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CENPBP07199 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms