Protein–RNA interactions for Protein: O95873

C6orf47, Uncharacterized protein C6orf47, humanhuman

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf47O95873 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
C6orf47O95873 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C6orf47O95873 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
C6orf47O95873 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
C6orf47O95873 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
C6orf47O95873 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C6orf47O95873 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C6orf47O95873 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
C6orf47O95873 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C6orf47O95873 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C6orf47O95873 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C6orf47O95873 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C6orf47O95873 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C6orf47O95873 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C6orf47O95873 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C6orf47O95873 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C6orf47O95873 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C6orf47O95873 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C6orf47O95873 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C6orf47O95873 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C6orf47O95873 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C6orf47O95873 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C6orf47O95873 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C6orf47O95873 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C6orf47O95873 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C6orf47O95873 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C6orf47O95873 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C6orf47O95873 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C6orf47O95873 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
C6orf47O95873 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
C6orf47O95873 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C6orf47O95873 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C6orf47O95873 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
C6orf47O95873 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C6orf47O95873 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C6orf47O95873 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
C6orf47O95873 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C6orf47O95873 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C6orf47O95873 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C6orf47O95873 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C6orf47O95873 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C6orf47O95873 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C6orf47O95873 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C6orf47O95873 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C6orf47O95873 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C6orf47O95873 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C6orf47O95873 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C6orf47O95873 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C6orf47O95873 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C6orf47O95873 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C6orf47O95873 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C6orf47O95873 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C6orf47O95873 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C6orf47O95873 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C6orf47O95873 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C6orf47O95873 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C6orf47O95873 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C6orf47O95873 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
C6orf47O95873 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C6orf47O95873 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
C6orf47O95873 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
C6orf47O95873 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C6orf47O95873 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C6orf47O95873 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C6orf47O95873 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C6orf47O95873 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C6orf47O95873 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C6orf47O95873 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C6orf47O95873 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C6orf47O95873 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C6orf47O95873 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C6orf47O95873 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C6orf47O95873 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C6orf47O95873 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C6orf47O95873 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C6orf47O95873 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C6orf47O95873 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C6orf47O95873 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
C6orf47O95873 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C6orf47O95873 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C6orf47O95873 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C6orf47O95873 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C6orf47O95873 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C6orf47O95873 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C6orf47O95873 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C6orf47O95873 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C6orf47O95873 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C6orf47O95873 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C6orf47O95873 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C6orf47O95873 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
C6orf47O95873 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C6orf47O95873 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C6orf47O95873 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C6orf47O95873 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C6orf47O95873 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C6orf47O95873 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C6orf47O95873 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C6orf47O95873 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C6orf47O95873 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C6orf47O95873 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms